RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	CIN1	P40987	1014 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MLC1	P53141	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MSC1	Q03104	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YML122C	Q03207	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ACL4	Q03771	387 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RNH1	Q04740	348 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PIG1	Q06216	648 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YLH47	Q06493	454 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	IRC10	Q08118	586 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
NUS1	YDL193W	SUT2	Q12286	268 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YRM1	Q12340	786 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RAV1	P47104	1357 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	GPA1	P08539	472 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	HNM1	P19807	563 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	URA4	P20051	364 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	COY1	P34237	679 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PXL1	P36166	706 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	UBA4	P38820	440 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ANS1	P38832	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	WSS1	P38838	269 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RTT105	P40063	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	EFM4	P40516	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RAD17	P48581	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YGL108C	P53139	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YTP1	P53584	459 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SEC5	P89102	971 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PNG1	Q02890	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ARP10	Q04549	284 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	COQ9	Q05779	260 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MMR1	Q06324	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ARV1	Q06541	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ARR1	Q06596	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
NUS1	YDL193W	COR1	P07256	457 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	NUP1	P20676	1076 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	VPS41	P38959	992 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MBB1	P39534	108 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ERV46	P39727	415 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SNG1	P46950	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YJL132W	P47014	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	AIM22	P47051	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TOM22	P49334	152 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	HOP2	P53187	214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TOF1	P53840	1238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MGR3	Q04472	501 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TPO3	Q06451	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	THP1	Q08231	455 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	UAF30	Q08747	228 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	VAM3	Q12241	283 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPB8	P20436	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ELO2	P25358	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YIM1	P28625	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SMI1	P32566	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
NUS1	YDL193W	CBP4	P37267	147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	STV1	P37296	890 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	VHC1	P38329	1120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	EFM2	P38347	419 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	LAG1	P38703	411 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	IRC7	P43623	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SHE10	P53075	577 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	DUG3	P53871	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ASI1	P54074	624 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SLG1	P54867	378 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SHR3	Q02774	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	FMP30	Q02883	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PPM1	Q04081	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	DCS1	Q06151	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	NDL1	Q06568	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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