RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	PHB1	P40961	287 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GUF1	P46943	645 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ATG36	P46983	293 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJR012C	P47087	207 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	COS12	P53053	380 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YGL242C	P53066	181 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MLC1	P53141	149 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	WSC2	P53832	503 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	USA1	Q03714	838 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAS2	Q06135	555 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YLR352W	Q06479	807 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GRS2	Q06817	618 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YDL086W	Q07505	273 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SOR2	Q07786	357 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	YOL107W	Q12239	342 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GTT2	Q12390	233 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ERP4	Q12450	207 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FOB1	O13329	566 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	COX2	P00410	251 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAL7	P08431	366 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAL3	P13045	520 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RDS1	P25611	832 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MSP1	P28737	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FRE1	P32791	686 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MRPS5	P33759	307 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SAS3	P34218	831 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TOM20	P35180	183 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SDH4	P37298	181 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YHI9	P38765	294 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SBE22	P38814	852 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PEX18	P38855	283 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YDR089W	P38966	869 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NUP82	P40368	713 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SER33	P40510	469 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YFL064C	P43540	174 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SNO3	P43544	222 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YFL015C	P43578	164 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GLG2	P47011	380 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SMC3	P47037	1230 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJR054W	P47114	497 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BNA2	P47125	453 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SOL1	P50278	321 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DOS2	P54858	310 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ACS1	Q01574	713 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PIR3	Q03180	325 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HOT1	Q03213	719 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ABZ2	Q03266	374 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ARA2	Q04212	335 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YPR202W	Q08993	238 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BAG7	Q12128	409 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NBP2	Q12163	236 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GIS3	Q12418	502 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RAX2	Q12465	1220 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SFG1	Q12507	346 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YOS9	Q99220	542 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ECM3	Q99252	613 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SEM1	O94742	89 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CKA2	P19454	339 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BUB3	P26449	341 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRR1	P28708	518 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CDC5	P32562	705 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TCA17	P32613	152 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YSC83	P32792	385 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SKT5	P34226	696 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CDS1	P38221	457 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VID24	P38263	362 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IML3	P38265	245 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EFM2	P38347	419 aa		0.44	□□□□□ -2.34

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