RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C MOH1P38191 138 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C OLA1P38219 394 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C REI1P38344 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SSP120P39931 234 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C AZF1P41696 914 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C VPS73P53142 486 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ATF2P53296 535 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SHR3Q02774 210 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RAD34Q06665 692 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PUS9Q12069 462 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SPT3P06844 337 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SPS22P25380 463 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MXR2P25566 168 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YMC1P32331 307 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NUP120P35729 1037 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RMA1P36001 430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PRP39P39682 629 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MET12P46151 657 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C LSC1P53598 329 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YOL159CQ08300 171 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SLP1Q12232 587 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C TPO4Q12256 659 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RGS2Q99188 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C HEM2P05373 342 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MRPL25P23369 157 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SSH4P32343 579 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SUI1P32911 108 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data6.62□□□□□ -1.35not detected
SPE3YPR069C ASC1P38011 319 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C FRT2P39734 528 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MAD2P40958 196 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CUP9P41817 306 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C TIM54P47045 478 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C IBD2P53892 351 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YNL092WP53934 400 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MPS1P54199 764 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C GIP3Q03016 1276 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CSN9Q03981 162 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C TAF11Q04226 346 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C BDS1Q08347 646 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YPL247CQ12523 523 aa6.62□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C GUK1P15454 187 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C TRX3P25372 127 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CMK1P27466 446 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C OAR1P35731 278 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YBR071WP38243 211 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C GID8P40208 455 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ROM1P53046 1155 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ROG1P53118 685 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C BOP2Q06150 570 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NUR1Q12066 484 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YOR342CQ12182 319 aa6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CDC8P00572 216 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ADH4P10127 382 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C GLK1P17709 500 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C KIP2P28743 706 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PHA2P32452 334 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CDC12P32468 407 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YME1P32795 747 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RRP14P36080 434 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C APT2P36973 181 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NEO1P40527 1151 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PHB1P40961 287 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SEC27P41811 889 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YRB1P41920 201 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MIC19P43594 170 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C BIO3P50277 480 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C EFM5P53200 248 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RMI1Q02685 241 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YMR209CQ03648 457 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YMR210WQ03649 449 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NUP53Q03790 475 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C PNP1Q05788 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YDL218WQ07629 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ENT4Q07872 247 aa6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C COX6P00427 148 aa6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C COR1P07256 457 aa6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C RTG1P32607 177 aa6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ASK1P35734 292 aa6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C HES1P35843 434 aa6.59□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C OMA1P36163 345 aa6.59□□□□□ -1.35
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