RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C SMA1Q02651 245 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MSC2Q03455 724 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPN4Q03465 531 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C APC4Q04601 652 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CRN1Q06440 651 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SYO1Q07395 620 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C THP3Q12049 470 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NUS1Q12063 375 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C JLP1Q12358 412 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARP7Q12406 477 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ATP1P07251 545 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MAS2P11914 482 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NSP1P14907 823 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SCD5P34758 872 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SRP72P38688 640 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MSC7P38694 644 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARN2P38724 620 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YHR078WP38799 552 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FKH2P41813 862 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SNG1P46950 547 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GTO1P48239 356 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SPC105P53148 917 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RTS3P53289 263 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COP1P53622 1201 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NUP100Q02629 959 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RRN5Q02983 363 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YDR124WQ04608 324 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PMT7Q06644 662 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C LDB18Q07887 179 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C THP1Q08231 455 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BUD7Q08754 746 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DDC1Q08949 612 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PGC1Q08959 321 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HUA2Q12134 243 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HSP42Q12329 375 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AFI1Q99222 893 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SPT3P06844 337 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ENA1P13587 1091 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C POX1P13711 748 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CHA1P25379 360 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NTG1P31378 399 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TKL2P33315 681 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FLR1P38124 548 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ATG7P38862 630 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YAR028WP39548 234 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MTW1P39731 289 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SER3P40054 469 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ESL1P40456 1118 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C IST3P40565 148 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PAC11P40960 533 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CDC1P40986 491 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GAB1P41733 394 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GYP8P43570 497 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STR3P53101 465 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SHY1P53266 389 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DAM1P53267 343 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STP1Q00947 519 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ENA2Q01896 1091 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RNH1Q04740 348 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RCO1Q04779 684 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COA4Q05809 96 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TRE2Q08693 809 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C YOR022CQ12204 715 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C ENA5Q12691 1091 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa5.22□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C ADE4P04046 510 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C GAL80P04387 435 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C HXK2P04807 486 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C SEC53P07283 254 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C MOD5P07884 428 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C GAL3P13045 520 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C RSR1P13856 272 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C MRPL33P20084 86 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C VPS33P20795 691 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C DBF2P22204 572 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C GRR1P24814 1151 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C OCA4P25366 362 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C MF(ALPHA)2P32435 120 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C MEI5P32489 222 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C CDC5P32562 705 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C MEP1P40260 492 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C YIR007WP40566 764 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C TOM22P49334 152 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C YNR063WP53749 607 aa5.21□□□□□ -1.58
SSZ1YHR064C HXT15P54854 567 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.5 ms