RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	GDA1	P32621	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BEM3	P32873	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GMH1	P36125	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MUM2	P38236	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CYC2	P38909	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MSS4	P38994	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MEP1	P40260	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	NBP35	P52920	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	FRE4	P53746	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RNT1	Q02555	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	NHP10	Q03435	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	EMI1	Q04406	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PUS6	YGR169C	VPS68	Q12016	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RMD5	Q12508	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	AMD2	P22580	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MRPL9	P31334	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SET3	P36124	751 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	WSC4	P38739	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YHR182W	P38870	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PFS1	P38872	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YJL107C	P42947	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CAF16	P43569	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SSY5	P47002	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BIR1	P47134	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	OSH6	Q02201	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SPP2	Q02521	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TAF11	Q04226	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YFT2	Q06676	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	NUS1	Q12063	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RGS2	Q99188	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	UBR1	P19812	1950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
PUS6	YGR169C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CIN8	P27895	1000 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SFP1	P32432	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CYM1	P32898	989 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TIP20	P33891	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TFC3	P34111	1160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	OAF3	P36023	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SPC42	P36094	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	HOS4	P40480	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	EXG2	P52911	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BOL2	P53082	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ZRG17	P53735	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SWS2	P53937	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ARP4	P80428	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	USA1	Q03714	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TRM82	Q03774	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RCO1	Q04779	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GRS2	Q06817	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PLB3	Q08108	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TRM8	Q12009	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SWM1	Q12379	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RSR1	P13856	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PHO3	P24031	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CTS1	P29029	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SPR1	P32603	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LTV1	P34078	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TIM17	P39515	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YJL206C	P39529	758 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ELO1	P39540	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PEP8	P40335	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	VHR1	P40522	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YJR142W	P47173	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BUD32	P53323	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YNL058C	P53947	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RED1	P14291	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PCL2	P25693	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms