RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MRPL22	P53881	309 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BUD14	P27637	709 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PMT2	P31382	759 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RPS27B	P38711	82 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SMF2	P38778	549 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHR219W	P38900	624 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MEF2	P39677	819 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YEL057C	P39983	233 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YEL020C	P39994	560 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MPS2	P53159	387 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PEX8	P53248	589 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	HOL1	P53389	586 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SSL2	Q00578	843 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	TFB2	Q02939	513 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YDR109C	Q04585	715 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ENT4	Q07872	247 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SLD7	Q08457	257 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	AVL9	Q12500	764 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YLR462W	O13556	202 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SAM35	P14693	329 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MET8	P15807	274 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MXR2	P25566	168 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SMI1	P32566	505 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	LHS1	P36016	881 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PCH2	P38126	564 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHL049C	P38722	271 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BAP3	P41815	604 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YFL064C	P43540	174 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PMT4	P46971	762 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BSC5	P53755	489 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YDR541C	Q03049	344 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YDR209C	Q03480	137 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PHO2	P07269	559 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ARG1	P22768	420 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PHO3	P24031	467 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RPN12	P32496	274 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	TOM20	P35180	183 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MET30	P39014	640 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ERG5	P54781	538 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	DAL4	Q04895	635 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YDR056C	Q12025	205 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	DAS2	Q12084	232 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YCL068C	P25593	260 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	KRE6	P32486	720 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YBR139W	P38109	508 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	OM14	P38325	134 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	OSW7	P43611	510 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ATG36	P46983	293 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PET130	P47065	347 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	KAP114	P53067	1004 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VPS75	P53853	264 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NHX1	Q04121	633 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ROY1	Q04847	553 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YOL159C	Q08300	171 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	HER1	Q12276	1246 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PST1	Q12355	444 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	QCR6	P00127	147 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ADE1	P27616	306 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PEX5	P35056	612 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SPC42	P36094	363 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	INM1	P38710	295 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VRG4	P40107	337 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MNT3	P40549	630 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	HOC1	P47124	396 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RIM8	P53179	542 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	INN1	P53901	409 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ATG29	Q12092	213 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	UPC2	Q12151	913 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53

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