RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	VPS25	P47142	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RHO4	Q00246	291 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SMA1	Q02651	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RSC9	Q03124	581 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SSK1	Q07084	712 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
DSD1	YGL196W	RDR1	Q08904	546 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	AEP3	Q12089	606 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	FRE7	Q12333	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	FRE6	Q12473	712 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	GAL4	P04386	881 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	TYR1	P20049	452 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	REC114	P32841	428 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MSN2	P33748	704 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	UIP5	P36137	443 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	DAD2	P36162	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	FLO10	P36170	1169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MMS4	P38257	691 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VHC1	P38329	1120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ECM27	P47144	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MLC1	P53141	149 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	PKP2	P53170	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ECI1	Q05871	280 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ATP10	P18496	279 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SER3	P40054	469 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	DCS1	Q06151	350 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	NFI1	Q12216	726 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ARP6	Q12509	438 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	EDE1	P34216	1381 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	BNR1	P40450	1375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	GID7	P25569	745 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MSP1	P28737	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SIN4	P32259	974 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VRG4	P40107	337 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VHS2	P40463	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SNM1	P40993	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	IAH1	P41734	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	BUD32	P53323	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	NUP100	Q02629	959 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RRD2	Q12461	358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MTR10	Q99189	972 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ERG11	P10614	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	UTR4	P32626	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CBP4	P37267	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPK3	P38070	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RFC3	P38629	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	TOF1	P53840	1238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CRC1	Q12289	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SEC63	P14906	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YCR007C	P25354	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
DSD1	YGL196W	ATP11	P32453	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YER130C	P39959	443 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	POP1	P41812	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPT11	P48559	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YNL181W	P53878	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PPM1	Q04081	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ATX2	Q12067	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPR089W	O13585	888 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SCEI	P03882	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	BAR1	P12630	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PHD1	P36093	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SPC34	P36131	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	EFM2	P38347	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	WSS1	P38838	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SYG1	P40528	902 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YIL024C	P40543	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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