RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W APM4Q99186 491 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KIN28P06242 306 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CBF1P17106 351 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W URE2P23202 354 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FUN26P31381 517 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BCS1P32839 456 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MSN4P33749 630 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LOT5P34234 306 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SPT10P35208 640 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MRPL7P36519 292 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W EGD2P38879 174 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W STL1P39932 569 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PIG2P40187 538 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KHA1P40309 873 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CCC1P47818 322 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RMR1P53060 241 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LCL3P53153 274 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PIB2P53191 635 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COX18P53239 316 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RCF2P53721 224 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YNR068CP53754 272 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VAC7P53950 1165 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YMD8Q03697 442 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NHX1Q04121 633 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SWF1Q04629 336 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RRT8Q08219 342 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ESA1Q08649 445 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPL272CQ08984 517 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YDR056CQ12025 205 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NUR1Q12066 484 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BAG7Q12128 409 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RBD2Q12270 262 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DCN1Q12395 269 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W EMP46Q12396 444 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NCB2Q92317 146 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W Q0142Q9ZZW4 58 aa3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ARG3P05150 338 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SST2P11972 698 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W POL30P15873 258 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RIT1P23796 513 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CTR86P25355 563 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PEP3P27801 918 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RAD24P32641 659 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SUR1P33300 382 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ELF1P36053 145 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HOT13P36078 116 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data3.37□□□□□ -1.87 RIP-Chip
VFA1YER128W BIT2P38346 545 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.37□□□□□ -1.87not detected
VFA1YER128W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AST2P39945 430 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ALG8P40351 577 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NUP82P40368 713 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TDA10P42938 290 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FMP32P43557 207 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NPA3P47122 385 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NPY1P53164 384 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NMA2P53204 395 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CBK1P53894 756 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BOP3P53958 396 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TOF2Q02208 771 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPL068CQ02749 293 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CWC27Q02770 301 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NHP10Q03435 203 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RUB1Q03919 77 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YMR027WQ04371 470 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VPS38Q05919 439 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DCR2Q05924 578 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VTA1Q06263 330 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MHR1Q06630 226 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GEP3Q08622 556 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SSP2Q08646 371 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FLC1Q08967 793 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TAF10Q12030 206 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FYV7Q12247 151 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ATG34Q12292 412 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LDB17Q12342 491 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TMA17Q12513 150 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MDM12Q92328 271 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ECM3Q99252 613 aa3.37□□□□□ -1.87
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