RNA–Protein interactions for RNA: YBL009W

ALK2, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene ALK2, Length 2,031 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALK2	YBL009W	VPS60	Q03390	229 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	VTI1	Q04338	217 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	TDA9	Q04545	1251 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	AIM32	Q04689	311 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	ECI1	Q05871	280 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	THI20	Q08224	551 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CIR2	Q08822	631 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.24	□□□□□ -2.05	not detected
ALK2	YBL009W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.23	□□□□□ -2.05	not detected
ALK2	YBL009W	GAL4	P04386	881 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PMS1	P14242	873 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PDE1	P22434	369 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	MEI4	P29467	408 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SYN8	P31377	255 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	GSH1	P32477	678 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	BYE1	P36106	594 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PCA1	P38360	1216 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	FLC2	P39719	783 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	LTP1	P40347	161 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	BET4	Q00618	327 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	ARA2	Q04212	335 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PIG1	Q06216	648 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	ATG23	Q06671	453 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	APC5	Q08683	685 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YDR018C	Q12185	396 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	FAB1	P34756	2278 aa		2.23	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	APE1	P14904	514 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SLY1	P22213	666 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YIH1	P25637	258 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	GPI10	P30777	616 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CNS1	P33313	385 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	APD1	P38281	316 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	FTH1	P38310	465 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	MSG5	P38590	489 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YMR134W	P40207	237 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	LAS21	P40367	830 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SAP185	P40856	1058 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YNL320W	P42840	284 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	RRT5	P43607	289 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SNG1	P46950	547 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YML6	P51998	286 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PEX31	P53203	462 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	INA17	Q02888	182 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PIR3	Q03180	325 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	STP3	Q05937	343 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	TPO3	Q06451	622 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	GEP3	Q08622	556 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YOR387C	Q08910	206 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	IZH4	Q99393	312 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	COX1	P00401	534 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	RPO26	P20435	155 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PPH22	P23595	377 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PEX34	P25584	144 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	GEX2	P36173	615 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	DUG2	P38149	878 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	ECM13	P38195	257 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	AIM18	P38884	321 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PRM9	P39551	298 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PUG1	P40100	303 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	MOB1	P40484	314 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CAB2	P40506	365 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	MIC19	P43594	170 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YGR079W	P53249	370 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	GPM3	Q12326	303 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	SFI1	Q12369	946 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	AVL9	Q12500	764 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	UBR1	P19812	1950 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ALK2	YBL009W	CDC8	P00572	216 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	PEP5	P12868	1029 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	CBF1	P17106	351 aa		2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
ALK2	YBL009W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06

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