RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)P

tT(UGU)P, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(UGU)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)PtT(UGU)P UTH1P36135 365 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RSC30P38781 883 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MBP1P39678 833 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SUM1P46676 1062 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SCW11P53189 542 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P FPK1P53739 893 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P KTR5P53966 522 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MPS1P54199 764 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SKY1Q03656 742 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P ERF2Q06551 359 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P WSC3Q12215 556 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RRD2Q12461 358 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P FAS2P19097 1887 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P LAA1P39526 2014 aa-0.42□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P PRI1P10363 409 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SNF5P18480 905 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RNQ1P25367 405 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P GFD2P25370 566 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SMY1P32364 656 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P BIO2P32451 375 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SLA1P32790 1244 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MTH1P35198 433 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P PXL1P36166 706 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RFS1P38234 210 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SFB3P38810 929 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P UBP9P39967 754 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P EPL1P43572 832 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MIG2P53035 382 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MCM6P53091 1017 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RNY1Q02933 434 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SPP1Q03012 353 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P VPS71Q03433 280 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P HIM1Q06674 414 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RIF1P29539 1916 aa-0.43□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P KEX2P13134 814 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SEN2P16658 377 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.44□□□□□ -2.48not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P PTP2P29461 750 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YKL097CP34245 136 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YPT53P36019 220 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TGL4P36165 910 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P ADH5P38113 351 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YJL206CP39529 758 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TIF4631P39935 952 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YAT2P40017 923 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P VPS27P40343 622 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P WWM1P43582 211 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P HIT1P46973 164 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YJL055WP47044 245 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P VPS70P47161 811 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P NST1P53935 1240 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P ORC1P54784 914 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SDH1Q00711 640 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P IRC15Q02733 499 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RLI1Q03195 608 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YML119WQ03208 357 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YMR210WQ03649 449 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YMR244WQ04018 355 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P HFD1Q04458 532 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RBS1Q05672 457 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P STP3Q05937 343 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YPR196WQ06595 470 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YRM1Q12340 786 aa-0.44□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RIM15P43565 1770 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P UBR1P19812 1950 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P RIP1P08067 215 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YFL068WP0CX99 160 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YLL066W-AP0CY00 160 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YLL067W-AP0CY01 160 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MIH1P23748 554 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YDJ1P25491 409 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P SEC1P30619 724 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P PTK1P36002 662 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YKR023WP36119 530 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TRS20P38334 175 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P MSC7P38694 644 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P HAL5P38970 855 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P IPL1P38991 367 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P UME6P39001 836 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P DHH1P39517 506 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P AZF1P41696 914 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P NCA3P46955 337 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P PRY3P47033 881 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P FAA4P47912 694 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P AMA1P50082 593 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P PBP1P53297 722 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TDA7P53882 636 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P CRZ1P53968 678 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TLG2Q08144 397 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P GAS5Q08193 484 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YPS3Q12303 508 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P TRM13Q12383 476 aa-0.45□□□□□ -2.48
tT(UGU)PtT(UGU)P YLR422WQ06409 1932 aa-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms