RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 TY1A-AP0CX57 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-ORP0CX59 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 SEC2P17065 759 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-JR2P47099 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-DR1Q03856 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 MET32Q12041 191 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-BRQ12217 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-NL2Q12470 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 TY1A-GR2Q12485 440 aa6.66□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 RRN7P40992 514 aa6.65□□□□□ -1.34
Q0143Q0143 PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 YGR035CP53222 116 aa6.62□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 ACO2P39533 789 aa6.6□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 YJR115WP47152 169 aa6.6□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 TFB4Q12004 338 aa6.6□□□□□ -1.35
Q0143Q0143 LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Q0143Q0143 CSC1Q06538 782 aa6.56□□□□□ -1.36
Q0143Q0143 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
Q0143Q0143 NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.53□□□□□ -1.36not detected
Q0143Q0143 ICP55P40051 511 aa6.52□□□□□ -1.37
Q0143Q0143 HPF1Q05164 967 aa6.51□□□□□ -1.37
Q0143Q0143 PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Q0143Q0143 KIC1P38692 1080 aa6.5□□□□□ -1.37
Q0143Q0143 YLR346CQ06139 101 aa6.46□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 PUS5Q06244 254 aa6.46□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 OPT2Q06593 877 aa6.46□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 YDR090CQ03193 310 aa6.43□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 YPR204WQ08995 1032 aa6.43□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 YIR007WP40566 764 aa6.42□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 MOD5P07884 428 aa6.4□□□□□ -1.38
Q0143Q0143 IFH1P39520 1085 aa6.38□□□□□ -1.39
Q0143Q0143 SRF1Q12516 437 aa6.36□□□□□ -1.39
Q0143Q0143 PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Q0143Q0143 GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Q0143Q0143 UGA3P26370 528 aa6.33□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 SCW11P53189 542 aa6.33□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 PHM7Q12252 991 aa6.33□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 KEX2P13134 814 aa6.32□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 ERF2Q06551 359 aa6.32□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 ORC6P38826 435 aa6.31□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 YPR109WQ06104 294 aa6.29□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 TY1A-BLQ12266 440 aa6.28□□□□□ -1.4
Q0143Q0143 MIP1P15801 1254 aa6.27□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 MDJ1P35191 511 aa6.27□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 NUP85P46673 744 aa6.25□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 DPH6Q12429 685 aa6.23□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Q0143Q0143 TUB4P53378 473 aa6.21□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 AGE1Q04412 482 aa6.19□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 RGR1P19263 1082 aa6.18□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 NSG2P53898 299 aa6.17□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
Q0143Q0143 UBP2Q01476 1272 aa6.13□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 KXD1P53158 218 aa6.12□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 TPD3P31383 635 aa6.09□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 ROG3P43602 733 aa6.09□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 LYS5P50113 272 aa6.09□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 LSC2P53312 427 aa6.09□□□□□ -1.43
Q0143Q0143 THI72Q08579 599 aa6.08□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 HXT10P43581 546 aa6.07□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 TY1A-MR1Q04215 440 aa6.06□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 KIP2P28743 706 aa6.05□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 RTT106P40161 455 aa6.04□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 JJJ3P47138 172 aa6.03□□□□□ -1.44
Q0143Q0143 CCP1P00431 361 aa6.01□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 ARG82P07250 355 aa6.01□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 OSH7P38755 437 aa6□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 YFL066CP43538 392 aa6□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 RTF1P53064 558 aa6□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 TCB1Q12466 1186 aa6□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 AI1P03875 834 aa5.99□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 IXR1P33417 597 aa5.99□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 COX6P00427 148 aa5.98□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 YNL115CP53925 644 aa5.98□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 PDC1P06169 563 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 AAD14P42884 376 aa5.97□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 YJR098CP47139 656 aa5.97□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.97□□□□□ -1.45
Q0143Q0143 DLD1P32891 587 aa5.95□□□□□ -1.46
Q0143Q0143 MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Q0143Q0143 SKN7P38889 622 aa5.88□□□□□ -1.47
Q0143Q0143 CLB5P30283 435 aa5.87□□□□□ -1.47
Q0143Q0143 ALR1Q08269 859 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.4 ms