RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	GIP4	P39732	760 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	LEM3	P42838	414 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	GSM1	P42950	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YGR026W	P53217	278 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TIM44	Q01852	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	FRE5	Q08908	694 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	LAA1	P39526	2014 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TEC1	P18412	486 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TRM2	P33753	639 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PEX6	P33760	1030 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YBR225W	P38321	900 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MSS4	P38994	779 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PLB1	P39105	664 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	FHL1	P39521	936 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	AFG3	P39925	761 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	FIS1	P40515	155 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	BIO4	P53630	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	ZRG17	P53735	605 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YDR090C	Q03193	310 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	VID22	Q05934	901 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	LDB18	Q07887	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TRP3	P00937	484 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PET122	P10355	254 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SCJ1	P25303	377 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TMA108	P40462	946 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	FIG4	P42837	879 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	CIT3	P43635	486 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PKP2	P53170	491 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MNT4	P53745	580 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MPS1	P54199	764 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	AIM33	Q04516	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	LAP2	Q10740	671 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	NMD4	Q12129	218 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RBD2	Q12270	262 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	APN1	P22936	367 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MKS1	P34072	584 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	IFA38	P38286	347 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	VAC8	P39968	578 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	EAF5	P39995	279 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MDE1	P47095	244 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PET117	Q02771	107 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RRN5	Q02983	363 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	NGL3	Q03210	505 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	THI7	Q05998	598 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SLD7	Q08457	257 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TFC8	Q12308	588 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RRD2	Q12461	358 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RMD5	Q12508	421 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MRP13	P12686	339 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SNF4	P12904	322 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	DIT1	P21623	536 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PET127	P32606	800 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	IXR1	P33417	597 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SUL1	P38359	859 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SBE22	P38814	852 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	DSS1	P39112	969 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YJR061W	P40355	935 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	ATG18	P43601	500 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YNL181W	P53878	407 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	YNL108C	P53929	270 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TVP15	Q03860	143 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	SEG1	Q04279	960 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PPZ1	P26570	692 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	NTG1	P31378	399 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PTC4	P38089	393 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PHO89	P38361	574 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	EFM1	P38732	585 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PGD1	P40356	397 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	LAS21	P40367	830 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RET2	P43621	546 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	MSE1	P48525	536 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	RMI1	Q02685	241 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	IRC15	Q02733	499 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	PEX29	Q03370	554 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	TCO89	Q08921	799 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPO31	YOR116C	ATP14	Q12349	124 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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