RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	TOM20	P35180	183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	LRG1	P35688	1017 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	DSS1	P39112	969 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	AZF1	P41696	914 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YFL012W	P43580	148 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	PMT4	P46971	762 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	KAP114	P53067	1004 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	SOV1	Q04748	898 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ROY1	Q04847	553 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MMT2	Q08970	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	NUS1	Q12063	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	DAS2	Q12084	232 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YRM1	Q12340	786 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	AVL9	Q12500	764 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	AI1	P03875	834 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	PHO2	P07269	559 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ARG1	P22768	420 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	PMT2	P31382	759 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	NFU1	P32860	256 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	THI80	P35202	319 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	RRN10	P38204	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	OM14	P38325	134 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	END3	P39013	349 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	SCC4	P40090	624 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	VRG4	P40107	337 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ATG36	P46983	293 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	HOC1	P47124	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MPS2	P53159	387 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YGR012W	P53206	393 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	BTN2	P53286	410 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	HOL1	P53389	586 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	INN1	P53901	409 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ATG29	Q12092	213 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	BAG7	Q12128	409 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
YNL057W	YNL057W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	ADE1	P27616	306 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	BEM3	P32873	1128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YBR139W	P38109	508 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	RCK2	P38623	610 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	TAT2	P38967	592 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YMR134W	P40207	237 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YGR015C	P53208	328 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	BSC5	P53755	489 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	CYK3	Q07533	885 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	MDM32	Q12171	622 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	HER1	Q12276	1246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	RGT2	Q12300	763 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	ICT1	Q12385	394 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	ATP12	P22135	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	RPB10	P22139	70 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	RAD57	P25301	460 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	MGR1	P25573	417 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	KRE6	P32486	720 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	APT2	P36973	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	EFM1	P38732	585 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	TCD1	P38756	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	FMP52	P40008	231 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	NDE1	P40215	560 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	MNT3	P40549	630 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	PET130	P47065	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	YJR149W	P47177	404 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	XYL2	Q07993	356 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	APL4	Q12028	832 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	COX17	Q12287	69 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	KAR1	P11927	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	STE6	P12866	1290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	ZIP1	P31111	875 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
YNL057W	YNL057W	SRB4	P32569	687 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL057W	YNL057W	VHC1	P38329	1120 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.6 ms