RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	YFT2	Q06676	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AIM41	Q12032	185 aa		4.2	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COX3	P00420	269 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	NDI1	P32340	513 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	HCS1	P34243	683 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YJL193W	P39542	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	KTR6	P54070	446 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CSI1	Q04368	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ARG7	Q04728	441 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	NDL1	Q06568	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	DFG16	Q99234	619 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PCT1	P13259	424 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	APL1	P27351	700 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ACP1	P32463	125 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	DSS4	P32601	143 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ALG14	P38242	237 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PEX7	P39108	375 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AFG3	P39925	761 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CIN1	P40987	1014 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YGR079W	P53249	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ATG9	Q12142	997 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VPS34	P22543	875 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SRB4	P32569	687 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TMN3	P40071	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VHS2	P40463	436 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MND2	P40577	368 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FKH2	P41813	862 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	IDS2	P46958	469 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COS5	P47187	383 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	BUD9	P53226	547 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	EFM6	P53970	246 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SKO1	Q02100	647 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COS7	Q07788	383 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RRD2	Q12461	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	URA4	P20051	364 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PEX1	P24004	1043 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YBR259W	P38338	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MND1	P53102	219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MTL1	P53214	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SPC98	P53540	846 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	IPI3	P53877	555 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MSC1	Q03104	513 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ERV41	Q04651	352 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COQ9	Q05779	260 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ATG23	Q06671	453 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	DAL81	P21657	970 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PET18	P25362	215 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ECM4	P36156	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	IRC8	P47046	822 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GIM3	P53900	129 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	STD1	Q02794	444 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CRT10	Q08226	957 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TGS1	Q12052	315 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YRM1	Q12340	786 aa		4.18	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MGR1	P25573	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YAP3	P38749	330 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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