RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	UFO1	Q04511	668 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GPN3	Q06543	272 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YEH1	Q07804	573 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GSH2	Q08220	491 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DDC1	Q08949	612 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
RRN11	YML043C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	CLN3	P13365	580 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ABF1	P14164	731 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	VPS33	P20795	691 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SEC62	P21825	274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YSP3	P25036	478 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	NFS1	P25374	497 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RAD24	P32641	659 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	JEN1	P36035	616 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ELF1	P36053	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YPK3	P38070	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SUL1	P38359	859 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RIM4	P38741	713 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YHR045W	P38775	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MGS1	P40151	587 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PCL7	P40186	285 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SLM1	P40485	686 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	IDS2	P46958	469 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YJL016W	P47072	561 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RPC17	P47076	161 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	USE1	P53146	245 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	TWF1	P53250	332 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SLI1	P53304	468 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SAM50	P53969	484 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PEX10	Q05568	337 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	BUR2	Q05949	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SNA4	Q07549	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COS7	Q07788	383 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RIM20	Q12033	661 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PSF3	Q12146	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DFG16	Q99234	619 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	STF1	P01098	86 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GCN4	P03069	281 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	CDC9	P04819	755 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RAD10	P06838	210 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MET2	P08465	486 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MET3	P08536	511 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YER152C	P10356	443 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AAC3	P18238	307 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SPO11	P23179	398 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YET1	P35723	206 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YKL133C	P36066	463 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YBR032W	P38223	100 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PCA1	P38360	1216 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	STB5	P38699	743 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GOS1	P38736	223 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	TRM5	P38793	499 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.73	not detected
RRN11	YML043C	SEO1	P39709	593 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SOK1	P40317	901 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ALG8	P40351	577 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GLG2	P47011	380 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SNF12	P53628	566 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SOV1	Q04748	898 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COQ9	Q05779	260 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ECM7	Q06200	448 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FEX2	Q08991	375 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ULA1	Q12059	462 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RRI2	Q12348	645 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	UBR1	P19812	1950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CTT1	P06115	562 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

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