RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	PUP1	P25043	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CSM1	P25651	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PHO91	P27514	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CLG1	P35190	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TSC10	P38342	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NVJ1	P38881	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RGI2	P40188	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MIC19	P43594	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	UFD1	P53044	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TGL2	P54857	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DID2	P69771	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NGL3	Q03210	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SOV1	Q04748	898 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CRF1	Q04930	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CRR1	Q05790	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RAX1	Q08760	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ATG31	Q12421	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RSF2	P46974	1380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RAD10	P06838	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	INO1	P11986	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ADP1	P25371	1049 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
SFI1	YLL003W	SRP101	P32916	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ICS2	P38284	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DOT5	P40553	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MRX6	P48564	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MEP3	P53390	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YNL034W	P53963	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YNL018C	P53976	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GPI17	Q04080	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
SFI1	YLL003W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	UNG1	P12887	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SAN1	P22470	610 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NDC1	P32500	655 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MTH1	P35198	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	STB6	P36085	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GPT2	P36148	743 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RIB5	P38145	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RMD6	P39975	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SER2	P42941	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NKP2	Q06162	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	QCR2	P07257	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DIT2	P21595	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YOX1	P34161	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	OAF3	P36023	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YBR071W	P38243	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YBP1	P38315	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CAF16	P43569	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AIM14	P53109	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YGR127W	P53275	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SLI1	P53304	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YTP1	P53584	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PEX13	P80667	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SAE3	P89114	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CDA1	Q06702	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TGS1	Q12052	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ULA1	Q12059	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MLH3	Q12083	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	VAM3	Q12241	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YOP1	Q12402	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	HTB2	P02294	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DST1	P07273	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ADY2	P25613	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PET127	P32606	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MNS1	P32906	549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SIF2	P38262	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LYS9	P38999	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YER130C	P39959	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected

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