RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PET117	Q02771	107 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YML037C	Q03703	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATG23	Q06671	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GSH2	Q08220	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	DSE3	Q08729	430 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	VIK1	Q12045	647 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GIS3	Q12418	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YPK2	P18961	677 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YPT7	P32939	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MRPL4	P36517	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RRT2	P38332	387 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERG7	P38604	731 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SUR2	P38992	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
KTR2	YKR061W	AFG3	P39925	761 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	VAB2	P40003	282 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YER085C	P40058	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SCC4	P40090	624 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ELP2	P42935	788 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YNR071C	P53757	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YNL143C	P53908	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	REG1	Q00816	1014 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RSN1	Q03516	953 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	VTA1	Q06263	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YFH1	Q07540	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YEH1	Q07804	573 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ACM1	Q08981	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YOS9	Q99220	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ISN1	Q99312	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CKA2	P19454	339 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	DAL81	P21657	970 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MAK31	P23059	88 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CMC1	P36064	111 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ALY1	P36117	915 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CDS1	P38221	457 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TDP1	P38319	544 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TAE1	P38340	232 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SMF2	P38778	549 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YHR182W	P38870	785 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BEM4	P39011	633 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	JHD1	P40034	492 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SLZ1	P40167	298 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SOL4	P53315	255 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BNA7	Q04066	261 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ECM11	Q04110	302 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CUR1	Q06469	252 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	UPC2	Q12151	913 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GPR1	Q12361	961 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PNS1	Q12412	539 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.34	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	VPS63	O13549	108 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	YPR089W	O13585	888 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	ARG80	P07249	177 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SEN2	P16658	377 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	CTS1	P29029	562 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	AIM26	P32858	118 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	CYM1	P32898	989 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	HCS1	P34243	683 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	YKL070W	P36087	169 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	POA1	P38218	177 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	POP7	P38291	140 aa		4.33	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms