RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	PPN1	Q04119	674 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	VTA1	Q06263	330 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	THI21	Q08975	551 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	OSW2	Q12202	724 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	VCX1	Q99385	411 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PDE2	P06776	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	HMG2	P12684	1045 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	CKA2	P19454	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ADY2	P25613	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YKR015C	P36111	568 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	STB5	P38699	743 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SFB3	P38810	929 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ELO3	P40319	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TAM41	P53230	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TWF1	P53250	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YGR126W	P53274	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	KTR6	P54070	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TRS31	Q03337	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RSN1	Q03516	953 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	AEP3	Q12089	606 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	GLE1	Q12315	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RAV1	P47104	1357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	NUP192	P47054	1683 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	UGA1	P17649	471 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	GEX1	P25596	615 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YIH1	P25637	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	NDI1	P32340	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	HXT1	P32465	570 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	OCT1	P35999	772 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	GEX2	P36173	615 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	FAD1	P38913	306 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	NUP60	P39705	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SER3	P40054	469 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YER085C	P40058	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	FKH2	P41813	862 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	IME4	P41833	600 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	BNA6	P43619	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YJL132W	P47014	750 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SMC3	P47037	1230 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	EFM3	P47163	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YGR149W	P48236	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	GTO1	P48239	356 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MTC3	P53077	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MRPL22	P53881	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ADY4	Q05955	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YFH1	Q07540	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SAM35	P14693	329 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SNF5	P18480	905 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PMA2	P19657	947 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	URA4	P20051	364 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PPH22	P23595	377 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PET18	P25362	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YCR015C	P25616	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ATP11	P32453	318 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	PET127	P32606	800 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RML2	P32611	393 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YKL071W	P36086	256 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MAL32	P38158	584 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	ALG5	P40350	334 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	NMD5	P46970	1048 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	YGL185C	P53100	379 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TIM21	P53220	239 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	COX18	P53239	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	TNA1	P53322	534 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MAL12	P53341	584 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	SNO2	P53823	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RSM28	Q03430	361 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YRA2	YKL214C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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