RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W RGI2P40188 164 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W RSM23Q01163 450 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W MSC1Q03104 513 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W FMP42Q04991 504 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W ECM30Q06673 1274 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W RDR1Q08904 546 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W NMD4Q12129 218 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W NCB2Q92317 146 aa3.6□□□□□ -1.83
THP2YHR167W MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W CDC23P16522 626 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W IMG1P25626 169 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W SPC34P36131 295 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W RKM3P38222 552 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W ERG7P38604 731 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W FLC2P39719 783 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W GUF1P46943 645 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W EAF6P47128 113 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W HUA2Q12134 243 aa3.59□□□□□ -1.83
THP2YHR167W BAR1P12630 587 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YUR1P26725 428 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SWE1P32944 819 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YKL100CP34248 587 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W PHD1P36093 366 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YER130CP39959 443 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W TMA108P40462 946 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MEP2P41948 499 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W FAR3P46671 204 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ATG27P46989 271 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SCS3P53012 380 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MDG1P53885 366 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YLR352WQ06479 807 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W NDD1Q08887 554 aa3.58□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SWI1P09547 1314 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SGF29P25554 259 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W IMP2'P32351 346 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YBR144CP34215 104 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W LAG1P38703 411 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YIR014WP40570 242 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W AZF1P41696 914 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MRX6P48564 524 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YGR127WP53275 312 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W PDR18P53756 1333 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W DIC1Q06143 298 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W GRS2Q06817 618 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YEH1Q07804 573 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YPT6Q99260 215 aa3.57□□□□□ -1.84
THP2YHR167W APC1P53886 1748 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SEC53P07283 254 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MRP13P12686 339 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MET8P15807 274 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W GLN3P18494 730 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W BOS1P25385 244 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SNC1P31109 117 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W GCS1P35197 352 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ROT2P38138 954 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W BZZ1P38822 633 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SAD1P43589 448 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W PTR3P43606 678 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YPL014WQ02606 381 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W MSS11Q03825 758 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W NKP2Q06162 153 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W TAH18Q12181 623 aa3.56□□□□□ -1.84
THP2YHR167W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84not detected
THP2YHR167W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W TYR1P20049 452 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W UBP11P36026 717 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ICS2P38284 255 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W AFG3P39925 761 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W CUL3P53202 744 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W VPS75P53853 264 aa3.55□□□□□ -1.84
THP2YHR167W YMR160WQ03823 816 aa3.55□□□□□ -1.84
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