RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	COQ3	P27680	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	DPH2	P32461	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	GYP6	P32806	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SLM4	P38247	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	LAG1	P38703	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SNG1	P46950	547 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	NMD5	P46970	1048 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YGR149W	P48236	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YGL108C	P53139	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	CUL3	P53202	744 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ATP23	P53722	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ORM2	Q06144	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	THP1	Q08231	455 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	PGC1	Q08959	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	HSP42	Q12329	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	PEP5	P12868	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	CNA1	P23287	553 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	BTN2	P53286	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	EOS1	P53938	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	MCP2	Q06567	569 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	DCI1	Q08558	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	UAF30	Q08747	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YIM1	P28625	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SNC1	P31109	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	AFG1	P32317	509 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	HEL1	P36113	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ROT2	P38138	954 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	THI2	P38141	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YHR054C	P38780	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YIL060W	P40519	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	HXT9	P40885	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SNO3	P43544	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	TOM22	P49334	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SHR3	Q02774	210 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	ACL4	Q03771	387 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RSF1	Q05043	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	MMR1	Q06324	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	POS5	Q06892	414 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	SIL1	Q08199	421 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	OSW1	Q08692	278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RRI1	Q12468	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RAV1	P47104	1357 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSD1	YGL196W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	PPZ2	P33329	710 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	STV1	P37296	890 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ARA1	P38115	344 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	DUG2	P38149	878 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	BNA4	P38169	460 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	LEU5	P38702	357 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YJR154W	P47181	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SOL4	P53315	255 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	DUG3	P53871	357 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MEH1	Q02205	184 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	PFA4	Q12006	378 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VPS54	Q12071	889 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SSN2	P38931	1420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	INO80	P53115	1489 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	RIP1	P08067	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SPO7	P18410	259 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	URA4	P20051	364 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MBR1	P23493	339 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	BRF1	P29056	596 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	EFM4	P40516	257 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	CFD1	P40558	293 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	ALT2	P52892	507 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VAM3	Q12241	283 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	SUC2	P00724	532 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	CLN1	P20437	546 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	GEX1	P25596	615 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	KRE2	P27809	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	HIR2	P32480	875 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSD1	YGL196W	YJL132W	P47014	750 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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