RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W ALT2P52892 507 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TOF2Q02208 771 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TLG2Q08144 397 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W THI20Q08224 551 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RLM1Q12224 676 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W FOB1O13329 566 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MET8P15807 274 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RPN12P32496 274 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SHP1P34223 423 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W ECM15P35195 104 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MDM31P38880 579 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YER130CP39959 443 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W CSM2P40465 213 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W DOT5P40553 215 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
NSE4YDL105W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
NSE4YDL105W YJR154WP47181 346 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W BUD32P53323 261 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MFB1Q04922 465 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W THP1Q08231 455 aa3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W REV1P12689 985 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W APE1P14904 514 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SRO77P38163 1010 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W AVT5P38176 459 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W NPR2P39923 615 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W IKS1P47042 667 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RBA50Q04418 439 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W COG4Q06096 861 aa3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
NSE4YDL105W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W BNA4P38169 460 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W CST26P38226 397 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SPO22P40511 975 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YDR239CQ03780 787 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W COQ9Q05779 260 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YOR365CQ08844 703 aa3.18□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W PRD1P25375 712 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MRE11P32829 692 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W PTR2P32901 601 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W FAA2P39518 744 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MET28P40573 187 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W PET130P47065 347 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TIM10P87108 93 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W IVY1Q04934 453 aa3.17□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W ARG3P05150 338 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W EXO70P19658 623 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SIP2P34164 415 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W DUG2P38149 878 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TCM62P38228 572 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W VID24P38263 362 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W ERP2P39704 215 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W NDE1P40215 560 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SHE10P53075 577 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W TWF1P53250 332 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W BOR1P53838 576 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SLD5Q03406 294 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YMR087WQ04299 284 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RIM20Q12033 661 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SEC39Q12745 709 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RTP1Q12751 981 aa3.16□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W RAV1P47104 1357 aa3.15□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W INH1P01097 85 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MRS3P10566 314 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YCR007CP25354 239 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W NDC1P32500 655 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W UTR4P32626 227 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MUM2P38236 366 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W VPS52P39904 641 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YEL057CP39983 233 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ESL1P40456 1118 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.15□□□□□ -1.91not detected
NSE4YDL105W AIM22P47051 409 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GPI1P53306 609 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MRPL19P53875 158 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPM2Q02773 1202 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ATG29Q12092 213 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YDL009CQ12210 107 aa3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YML133CQ03099 1374 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YLL067CQ07888 1374 aa3.14□□□□□ -1.91
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