RNA–Protein interactions for RNA: YPL134C

ODC1, Transcript of Mitochondrial inner membrane transporter, yeastyeast

Gene ODC1, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ODC1YPL134C SPC105P53148 917 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C EFM5P53200 248 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YNL018CP53976 612 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ARP4P80428 489 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ENA2Q01896 1091 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PPN1Q04119 674 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RIF2Q06208 395 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NBP2Q12163 236 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C JLP1Q12358 412 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ENA5Q12691 1091 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YPL119C-AQ3E751 87 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MHF1Q3E835 90 aa8.58□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C TIM9O74700 87 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C COX5AP00424 153 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PRC1P00729 532 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SEC53P07283 254 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C AAT2P23542 418 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PTC6P25646 442 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YUR1P26725 428 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GAC1P28006 793 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C COX13P32799 129 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MRPL6P32904 214 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SKT5P34226 696 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C UTP30P36144 274 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SLX1P38324 304 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C IPT1P38954 527 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YEL020CP39994 560 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FET5P43561 622 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PTR3P43606 678 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C HOC1P47124 396 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SAP4P53036 818 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C COP1P53622 1201 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C BLS1Q06071 122 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SWC7Q06707 132 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GPB1Q08886 897 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C DDC1Q08949 612 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RMD5Q12508 421 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YBL113CQ7M4S9 792 aa8.57□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GIT1P25346 518 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RAD27P26793 382 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C CDC5P32562 705 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FLR1P38124 548 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ARN2P38724 620 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YLF2P38746 405 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FHL1P39521 936 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YAR028WP39548 234 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FAR7P43592 221 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NAS6P50086 228 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SCS3P53012 380 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ARO8P53090 500 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C TIM13P53299 105 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MRPL13Q02204 264 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PET117Q02771 107 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NHP10Q03435 203 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GOT1Q03554 138 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SYO1Q07395 620 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NUS1Q12063 375 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MHF2Q3E829 80 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RIB3Q99258 208 aa8.56□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C HSP30P25619 332 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RIB1P38066 345 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SLX8P40072 274 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ELO3P40319 345 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ESL1P40456 1118 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PAC11P40960 533 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FKH2P41813 862 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NUP85P46673 744 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ARH1P48360 493 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ISM1P48526 1002 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GRX5Q02784 150 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MSC2Q03455 724 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C SPO20Q04359 397 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YDR109CQ04585 715 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C GRX8Q05926 109 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C NEJ1Q06148 342 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C APC5Q08683 685 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C YOR022CQ12204 715 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data8.55□□□□□ -1.04not detected
ODC1YPL134C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C PST2Q12335 198 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C FRT1Q99332 602 aa8.55□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa8.54□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C ATP1P07251 545 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C MAS2P11914 482 aa8.54□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C CLN2P20438 545 aa8.54□□□□□ -1.04
ODC1YPL134C DBF2P22204 572 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms