RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FMP33	P46998	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GCV2	P49095	1034 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AIF1	P52923	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TEL2	P53038	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YGR016W	P53209	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	COG2	P53271	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GND2	P53319	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPC98	P53540	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ORC3	P54790	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CSN9	Q03981	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TAF11	Q04226	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YKU80	Q04437	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GLO2	Q05584	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ASA1	Q06822	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HOS1	Q12214	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	GPR1	Q12361	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NSI1	Q12457	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RHO2	P06781	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPS1	P08458	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	APE1	P14904	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NDI1	P32340	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RPD3	P32561	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SMI1	P32566	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SRP101	P32916	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PTC1	P35182	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ASK1	P35734	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FAT1	P38225	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHL026C	P38740	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PTC7	P38797	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CTF8	P38877	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BEM4	P39011	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GIP4	P39732	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HPM1	P40481	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AZR1	P50080	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NUP84	P52891	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ALT2	P52892	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SLD3	P53135	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NPY1	P53164	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TIM13	P53299	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ARP4	P80428	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NBP2	Q12163	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ARP7	Q12406	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	COX5A	P00424	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PRC1	P00729	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GAL80	P04387	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AMD2	P22580	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YIH1	P25637	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BEM1	P29366	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ZIP1	P31111	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BEM3	P32873	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TKL2	P33315	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TFC3	P34111	1160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SIF2	P38262	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	LAM1	P38851	1228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TDA11	P38854	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PRM9	P39551	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AFG3	P39925	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PRM2	P40534	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GTS1	P40956	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YGR012W	P53206	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YTP1	P53584	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHM2	Q04013	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AIM32	Q04689	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CRN1	Q06440	651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CDA2	Q06703	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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