RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	TEN1	Q07921	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PCL5	P38794	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CIN4	P39110	191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RTT105	P40063	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CHS6	P40955	746 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YJL132W	P47014	750 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SHE4	P51534	789 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CPR8	P53728	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CDC45	Q08032	650 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	AEP3	Q12089	606 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	HER1	Q12276	1246 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SPO7	P18410	259 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	URA4	P20051	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CLN1	P20437	546 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ELO2	P25358	347 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RAD14	P28519	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SUR1	P33300	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	OPT1	P40897	799 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YNL058C	P53947	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	COQ9	Q05779	260 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ARO10	Q06408	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MED2	Q12124	431 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SPS4	P09937	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YIM1	P28625	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	AFG1	P32317	509 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YMC2	P38087	329 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	DBP8	P38719	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	BDH2	P39713	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MIT1	P40002	666 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	OSW5	P40219	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YTA12	P40341	825 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YIL089W	P40500	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YJL107C	P42947	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	EPL1	P43572	832 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YFL015C	P43578	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YGL117W	P53133	265 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MSC1	Q03104	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MDY2	Q12285	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	INO80	P53115	1489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ARG81	P05085	880 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	HCM1	P25364	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	DAL80	P26343	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	GAC1	P28006	793 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	SPC110	P32380	944 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ARA1	P38115	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YHL017W	P38745	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YHR218W	P38899	603 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ECM27	P47144	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
RPS0B	YLR048W	TOF2	Q02208	771 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	UBX3	Q12229	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	RIB7	P33312	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	SRB2	P34162	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	MRPL4	P36517	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	TDA10	P42938	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ATG27	P46989	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	TOM22	P49334	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YPR003C	P53394	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	AQR1	P53943	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS0B	YLR048W	VAM3	Q12241	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms