RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	GID8	P40208	455 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MLC1	P53141	149 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TOF2	Q02208	771 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TRS31	Q03337	283 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VPS38	Q05919	439 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VTA1	Q06263	330 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ARV1	Q06541	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AIM6	Q07716	390 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SUL2	Q12325	893 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PUT4	P15380	627 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	KIN82	P25341	720 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PRE4	P30657	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	UTR4	P32626	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YPT7	P32939	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CMC1	P36064	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AGP2	P38090	596 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YHR078W	P38799	552 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SFB3	P38810	929 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SAK1	P38990	1142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RNT1	Q02555	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PPM1	Q04081	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DON1	Q05610	365 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DAP1	Q12091	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YPT6	Q99260	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VCX1	Q99385	411 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YHL017W	P38745	532 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CTF8	P38877	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CHS6	P40955	746 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ALT2	P52892	507 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VID30	P53076	958 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	COX18	P53239	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TWF1	P53250	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	INN1	P53901	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CSI1	Q04368	295 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SOV1	Q04748	898 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SWT1	Q12104	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AVL9	Q12500	764 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YUR1	P26725	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NTH1	P32356	751 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MTC7	P32633	139 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	HCS1	P34243	683 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YSW1	P38280	609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	IDS2	P46958	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LSB1	P53281	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRPS35	P53292	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SOL4	P53315	255 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YGR266W	P53326	701 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	AQR1	P53943	586 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SLD5	Q03406	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MCM21	Q06675	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SWM1	Q12379	170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YIH1	P25637	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PMT1	P33775	817 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RRT2	P38332	387 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YBR259W	P38338	688 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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