RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	PDE2	P06776	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	CNA1	P23287	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	KAP122	P32767	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	LSB6	P42951	607 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	BRE2	P43132	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	PAC10	P48363	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	MET31	Q03081	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	CHS1	P08004	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	SEC2	P17065	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	MRM1	P25270	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	HCS1	P34243	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	MRP8	P35719	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YHI9	P38765	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YAT2	P40017	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	RET2	P43621	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	GPI8	P49018	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	MRPL50	P53724	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	SFH1	Q06168	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	SWC7	Q06707	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YKL151C	P36059	337 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YBR053C	P38235	358 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	UBA4	P38820	440 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	FHL1	P39521	936 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	TIM54	P47045	478 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	IMA1	P53051	589 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	ROG1	P53118	685 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	NMA2	P53204	395 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	INP2	Q03824	705 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	AIM32	Q04689	311 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	LOT6	Q07923	191 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YOR1	YGR281W	SET3	P36124	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	IRC5	P43610	853 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RRN11	Q04712	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TUP1	P16649	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	EPT1	P22140	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PEX1	P24004	1043 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SRP101	P32916	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MED8	P38304	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	LOH1	P47055	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SPT20	P50875	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	COS10	P52924	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RMI1	Q02685	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	APC4	Q04601	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FEX2	Q08991	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SFG1	Q12507	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MED11	Q99278	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MCM7	P38132	845 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	UBX7	P38349	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YHR218W	P38899	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	EMI1	Q04406	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FEX1	Q08913	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CMK2	P22517	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SRB5	P32585	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FMP23	P38231	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	EHT1	P38295	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YHR131C	P38835	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YHR219W	P38900	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	GDH3	P39708	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NDE1	P40215	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YRB2	P40517	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RRT5	P43607	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	HOC1	P47124	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SPP1	Q03012	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	AVL9	Q12500	764 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CMP2	P14747	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DMC1	P25453	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NAM9	P27929	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	AIM14	P53109	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	KXD1	P53158	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms