RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 CAF120P53836 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 BSC2Q05611 235 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MCD1Q12158 566 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PSY3Q12318 242 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 COX6P00427 148 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CCZ1P38273 704 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HSL7P38274 827 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CWC21Q03375 135 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 FEX2Q08991 375 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 KCS1Q12494 1050 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MRT4P33201 236 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MTW1P39731 289 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ULI1P43604 169 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ERP3Q12403 225 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CAR1P00812 333 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 VBA3P25594 458 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PHA2P32452 334 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 VBA5P36172 582 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 UPF3P48412 387 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CUS2P53830 285 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SNU56Q03782 492 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HRT3Q12347 344 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 LRE1P25579 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MRP4P32902 394 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 VAM7P32912 316 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CDS1P38221 457 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ATG12P38316 186 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SSO2P39926 295 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ASN2P49090 572 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MND1P53102 219 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HER1Q12276 1246 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HMS1Q12398 434 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 COX4P04037 155 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ERR1P0CX10 437 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ERR2P0CX11 437 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 NSP1P14907 823 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 AMS1P22855 1083 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 TFC1P32367 649 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SSE2P32590 693 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 AIM2P39721 246 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PZF1P39933 429 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ERR3P42222 437 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MNP1P53163 194 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HNM1P19807 563 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data9.49□□□□□ -0.89not detected
RDN25-1RDN25-1 MSS4P38994 779 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 FMP10P40098 244 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 AZR1P50080 613 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 TPN1P53099 579 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 GUD1Q07729 489 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ADE4P04046 510 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 NFT1P0CE68 1218 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MER1P16523 270 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 STF2P16965 84 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MKS1P34072 584 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 MMS4P38257 691 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 RRT5P43607 289 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 RRT6P53117 311 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 REC102Q02721 264 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YPL034WQ03083 165 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 TPO1Q07824 586 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 TRM8Q12009 286 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CYS4P32582 507 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 KSP1P38691 1029 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 BZZ1P38822 633 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YHR202WP38887 602 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YGR117CP53270 476 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ERV25P54837 211 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SCS7Q03529 384 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 COS111P38308 924 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PHM8P40025 321 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CIN1P40987 1014 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PPT1P53043 513 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 NMA2P53204 395 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YMR279CQ03263 540 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 EAF1Q06337 982 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 NGL1Q08213 363 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
RDN25-1RDN25-1 RHO2P06781 192 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YKL100CP34248 587 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YBL029WP38201 376 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 PNT1P38969 423 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YEL025CP39991 1188 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 BIO3P50277 480 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
RDN25-1RDN25-1 DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 GSH2Q08220 491 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ULA1Q12059 462 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 YPR027CQ12079 277 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 HAL9Q12180 1030 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 IZH4Q99393 312 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 RAP1P11938 827 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 SEC61P32915 480 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 APM3P38153 483 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 CRP1P38845 465 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-1RDN25-1 GIP4P39732 760 aa9.47□□□□□ -0.89
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