RNA–Protein interactions for RNA: YOL063C

CRT10, Transcript of Protein involved in transcriptional regulation of RNR2 and RNR3, yeast

Gene CRT10, Length 2,874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRT10	YOL063C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YBL028C	P38202	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	EXO1	P39875	702 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MNN5	P46982	586 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	AVT1	P47082	602 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	NAS6	P50086	228 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	IPI3	P53877	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	APC4	Q04601	652 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MRX10	Q05648	414 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	COS7	Q07788	383 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	WHI5	Q12416	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ARA1	P38115	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YBL029W	P38201	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	RIM11	P38615	370 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MNN1	P39106	762 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SWD1	P39706	426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	NPR2	P39923	615 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	FIR1	P40020	876 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	COA1	P40452	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GCD10	P41814	478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GSM1	P42950	618 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MDE1	P47095	244 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ROM1	P53046	1155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	COG1	P53079	417 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GCN5	Q03330	439 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	HER2	Q03557	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GAS3	Q03655	524 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ECM7	Q06200	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ARO10	Q06408	635 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SLD7	Q08457	257 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YNG1	Q08465	219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PGC1	Q08959	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	HFI1	Q12060	488 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
CRT10	YOL063C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YCL068C	P25593	260 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	FUN30	P31380	1131 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	TGL1	P34163	548 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	RIB1	P38066	345 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YHR219W	P38900	624 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	MGS1	P40151	587 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YKE4	P40544	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
CRT10	YOL063C	YJL181W	P46987	611 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YJL049W	P47048	450 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YNL146W	P53906	100 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	DID2	P69771	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	RAD33	Q04231	177 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SEG1	Q04279	960 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	BCH1	Q05029	724 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GAS5	Q08193	484 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	UAF30	Q08747	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ACF2	Q12168	779 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	OSW2	Q12202	724 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SUC2	P00724	532 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	PRR1	P28708	518 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	BAP2	P38084	609 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YHR045W	P38775	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SER2	P42941	309 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	CUL3	P53202	744 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	ZRG17	P53735	605 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	VTA1	Q06263	330 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	HUA2	Q12134	243 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	COX6	P00427	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	GAL10	P04397	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	SGF29	P25554	259 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	EMC1	P25574	760 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	DPH2	P32461	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	UTR2	P32623	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CRT10	YOL063C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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