RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	OSH6	Q02201	448 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	PET117	Q02771	107 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ROT1	Q03691	256 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	GRS2	Q06817	618 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	YOL024W	Q08172	172 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ACM1	Q08981	209 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	DIN7	Q12086	430 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	MST1	P07236	462 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	OXP1	P28273	1286 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	MRP21	P38175	177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	YHL008C	P38750	627 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	REV7	P38927	245 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ACO2	P39533	789 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	YMR134W	P40207	237 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	INA22	P40576	216 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	AXL1	P40851	1208 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	TAH11	P47112	604 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ECM9	Q02202	377 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	GPR1	Q12361	961 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	PNS1	Q12412	539 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	AI4	P03878	556 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	CLB4	P24871	460 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	GID7	P25569	745 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	SMI1	P32566	505 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	PET112	P33893	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
NDC1	YML031W	FZO1	P38297	855 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	MMS21	P38632	267 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	SSN3	P39073	555 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	SEO1	P39709	593 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	YIL001W	P40560	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	MDJ2	P42834	146 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	ASK10	P48361	1146 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NDC1	YML031W	SPS1	P08458	490 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	INO1	P11986	533 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	PEP5	P12868	1029 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	IMG1	P25626	169 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RSC6	P25632	483 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	GUT2	P32191	649 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	PEX5	P35056	612 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SCC4	P40090	624 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ERP6	P53198	216 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SHE9	Q04172	456 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	YDR109C	Q04585	715 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ENT2	Q05785	613 aa		5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SWI5	P08153	709 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	IMA3	P0CW40	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	IMA4	P0CW41	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	YCL068C	P25593	260 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	YHR045W	P38775	560 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	VNX1	P42839	908 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ARH1	P48360	493 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	PEX8	P53248	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	NNF2	P53253	936 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SHR3	Q02774	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RSF1	Q05043	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	IMA2	Q08295	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
NDC1	YML031W	BMT6	Q12291	365 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	LAG2	Q92325	660 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RAD51	P25454	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SIN4	P32259	974 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	LYP1	P32487	611 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	GDA1	P32621	518 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	YBR032W	P38223	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	MSG5	P38590	489 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ZIP2	P53061	704 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	NHX1	Q04121	633 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RSC3	Q06639	885 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	SLD7	Q08457	257 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	GYP1	Q08484	637 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	RMD5	Q12508	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NDC1	YML031W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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