RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	HPF1	Q05164	967 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YLR407W	Q06070	228 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	BRE4	Q07660	1125 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	HMS1	Q12398	434 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	BCK1	Q01389	1478 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RPN13	O13563	156 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PAH1	P32567	862 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SDS22	P36047	338 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	ALG3	P38179	458 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	APM2	P38700	605 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YHR202W	P38887	602 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	ATF1	P40353	525 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	MAK10	Q02197	733 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SHR3	Q02774	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SMP3	Q04174	516 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YDR514C	Q04408	483 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	BLS1	Q06071	122 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PDR8	Q06149	701 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RRT8	Q08219	342 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	FMP16	Q12497	93 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	GAL7	P08431	366 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CDC34	P14682	295 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	AEP2	P22136	580 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	MIH1	P23748	554 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RPC25	P35718	212 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YRB2	P40517	327 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YNR061C	P53747	219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CAF40	P53829	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SIW14	P53965	281 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SED5	Q01590	340 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RMT2	Q03305	412 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	HIM1	Q06674	414 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DIN7	Q12086	430 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	TY3A-G	Q12173	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	TY3A-I	Q99219	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YRF1-2	P40105	1681 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	ABF1	P14164	731 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	MET8	P15807	274 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	EXO70	P19658	623 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PRE8	P23639	250 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	CWH43	P25618	953 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	GPI10	P30777	616 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RAD24	P32641	659 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SRP101	P32916	621 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DUG2	P38149	878 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	COS111	P38308	924 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SOH1	P38633	127 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SMF2	P38778	549 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SBE22	P38814	852 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PZF1	P39933	429 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YJR061W	P40355	935 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	HPM1	P40481	377 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	UFE1	P41834	346 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	AIM24	P47127	394 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	USE1	P53146	245 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	NMA2	P53204	395 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	OKP1	P53298	406 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DSE4	P53753	1117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	APP1	P53933	587 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YPL107W	Q02873	248 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	YMR279C	Q03263	540 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	COS7	Q07788	383 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	NTO1	Q12311	748 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	DCN1	Q12395	269 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	SET6	Q12529	373 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	URA3	P03962	267 aa		6.54	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
HMS2	YJR147W	STE3	P06783	470 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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