RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	BMT2	P38278	337 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YIL001W	P40560	513 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	EFM3	P47163	339 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ATG21	Q02887	496 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YDR444W	Q04093	687 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YPQ2	Q06328	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CTS2	Q06350	511 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YFT2	Q06676	274 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YFH1	Q07540	174 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NUS1	Q12063	375 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	WTM2	Q12206	467 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NTO1	Q12311	748 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DIF1	O13577	133 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YSR3	P23501	404 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SYN8	P31377	255 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CSE1	P33307	960 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	AST1	P35183	429 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ADD66	P36040	267 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CDS1	P38221	457 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SLM4	P38247	162 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PZF1	P39933	429 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YJL107C	P42947	387 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HXT10	P43581	546 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NMD5	P46970	1048 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HIT1	P46973	164 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RTT102	P53330	157 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DIA1	P54005	336 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ACF2	Q12168	779 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MDS3	P53094	1487 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YKR051W	P36142	418 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PPS1	P38148	807 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MAL33	P38157	468 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ICE2	P40499	491 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DSN1	P40568	576 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YGL159W	P53110	370 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PEX12	Q04370	399 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DUS4	Q06063	367 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	REX4	Q08237	289 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	UAF30	Q08747	228 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
SET1	YHR119W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SEY1	Q99287	776 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PDE2	P06776	526 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CDC21	P06785	304 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SNF6	P18888	332 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GIT1	P25346	518 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MLF3	P32047	452 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YPT7	P32939	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ALY1	P36117	915 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GAB1	P41733	394 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YJL171C	P46992	396 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SSN8	P47821	323 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	IMA1	P53051	589 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YNR065C	P53751	1116 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MRP51	Q02950	344 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	AAD4	Q07747	329 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DAP1	Q12091	152 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	BMT6	Q12291	365 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HIP1	P06775	603 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YCR061W	P25639	631 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	THI2	P38141	450 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SWC5	P38326	303 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SFB3	P38810	929 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YER158C	P40095	573 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FKH2	P41813	862 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	BST1	P43571	1029 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YGR042W	P53227	271 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PPN1	Q04119	674 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SIL1	Q08199	421 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ISU2	Q12056	156 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MSH5	Q12175	901 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FMP16	Q12497	93 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PRC1	P00729	532 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	CHS1	P08004	1131 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.27	□□□□□ -1.89

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