RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	SOL4	P53315	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	HST1	P53685	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YML037C	Q03703	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	GTB1	Q04924	702 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SCW10	Q04951	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SUE1	Q06524	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	TIP41	Q12199	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	MSP1	P28737	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YND1	P40009	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	LYS14	P40971	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YGL138C	P53122	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ESBP6	P53918	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	CAC2	Q04199	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ARP9	Q05123	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ECI1	Q05871	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PET122	P10355	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SIR1	P21691	654 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	BZZ1	P38822	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	NDT80	P38830	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	VAB2	P40003	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ASE1	P50275	885 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	LSB1	P53281	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	CEX1	Q12453	761 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	TPM2	P40414	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MSY1	P48527	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	FMS1	P50264	508 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RBA50	Q04418	439 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SUL2	Q12325	893 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MPD2	Q99316	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	ROX1	P25042	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SAS3	P34218	831 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	APM3	P38153	483 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RET3	P53600	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YNL234W	P53857	426 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	TEP1	P53916	434 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SND1	Q04007	877 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	STP3	Q05937	343 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MOT1	P32333	1867 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	ALG1	P16661	449 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	UTR4	P32626	227 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	ERG7	P38604	731 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	ZAP1	P47043	880 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	AIM33	Q04516	312 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SPH1	Q06160	661 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	SHP1	P34223	423 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	GAA1	P39012	614 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RSM25	P40496	264 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	IML2	P47031	731 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	LIF1	P53150	421 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	CSM3	Q04659	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RTT103	Q05543	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MMR1	Q06324	491 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	BAG7	Q12128	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RPN12	P32496	274 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YER130C	P39959	443 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	RTC4	P53850	401 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	YNL181W	P53878	407 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	TGL2	P54857	326 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SLX1	YBR228W	PFA5	Q03289	374 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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