RNA–Protein interactions for RNA: YMR263W

SAP30, Transcript of Component of Rpd3L histone deacetylase complex, yeast

Gene SAP30, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP30	YMR263W	ACO2	P39533	789 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	ALG8	P40351	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	HOS4	P40480	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PEX8	P53248	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	FRE4	P53746	719 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PET117	Q02771	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	MCP2	Q06567	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	OMS1	Q06668	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	OPI10	Q08202	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	VHS3	Q08438	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	UPC2	Q12151	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PHO3	P24031	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	EMC1	P25574	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PMT1	P33775	817 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	RRN3	P36070	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	LDB7	P38210	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	TAE1	P38340	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PCL5	P38794	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	YHR078W	P38799	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	AIM46	P38885	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	TAT2	P38967	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	RGA1	P39083	1007 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PEP8	P40335	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	IRR1	P40541	1150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	DSN1	P40568	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	NBP35	P52920	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	BUD32	P53323	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	SLT2	Q00772	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	OSH6	Q02201	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	RNT1	Q02555	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	TFB2	Q02939	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	CSN9	Q03981	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	PPN1	Q04119	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	RSC2	Q06488	889 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	APC9	Q12107	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	SLP1	Q12232	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SAP30	YMR263W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SUC2	P00724	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	GAL11	P19659	1081 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	AAD3	P25612	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YCR051W	P25631	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	RML2	P32611	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	TOM20	P35180	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	ASK1	P35734	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	PHO89	P38361	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	REV7	P38927	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	GIP4	P39732	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	GTS1	P40956	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YJR115W	P47152	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SWC4	P53201	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SNO2	P53823	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	FAR8	Q05040	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	ADY3	Q07732	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	ATG10	Q07879	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	NUS1	Q12063	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	GNT1	Q12096	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	UBX3	Q12229	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	NCA2	Q12374	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	RGS2	Q99188	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	PRI2	P20457	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	HCM1	P25364	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	CSE1	P33307	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	DUT1	P33317	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP30	YMR263W	YDR089W	P38966	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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