RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TOF1	P53840	1238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ATG4	P53867	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	IPI3	P53877	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	EFM6	P53970	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TRS23	Q03784	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DON1	Q05610	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LCB4	Q12246	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TPK2	P06245	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MRP13	P12686	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MSP1	P28737	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YME2	P32843	850 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YBR144C	P34215	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HCS1	P34243	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LHS1	P36016	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RRT2	P38332	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PHM8	P40025	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ATF1	P40353	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PKP1	P40530	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	FAR3	P46671	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RIM8	P53179	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YML053C	Q04978	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RPS0B	YLR048W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ALG7	P07286	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PCT1	P13259	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SNT1	P25357	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RML2	P32611	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DAD2	P36162	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SIF2	P38262	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ECM10	P39987	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DCI1	Q08558	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	INP53	Q12271	1107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LAM4	P38800	1345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SGS1	P35187	1447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GDA1	P32621	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GYP6	P32806	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	COG2	P53271	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YGR127W	P53275	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YNL144C	P53907	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ADA2	Q02336	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RNT1	Q02555	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	APL4	Q12028	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TAF3	Q12297	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	WHI2	P12611	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GSH1	P32477	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TOD6	P34219	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	THI2	P38141	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SLM4	P38247	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GIP4	P39732	760 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ARG2	P40360	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ASG1	P40467	964 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	FET5	P43561	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	STB2	P46679	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	COQ6	P53318	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ATG9	Q12142	997 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YLR358C	O13565	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HIP1	P06775	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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