RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	APM3	P38153	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CTF18	P49956	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SGF73	P53165	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GYL1	Q04322	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	HOF1	Q05080	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	COQ11	Q05892	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ARR1	Q06596	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	HER1	Q12276	1246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	BIK1	P11709	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DOA4	P32571	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YPT53	P36019	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TCB2	P48231	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MLC1	P53141	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	BUG1	Q12191	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PSY3	Q12318	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TPK1	P06244	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ADH4	P10127	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
ACT1	YFL039C	SPS22	P25380	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SRB4	P32569	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GCS1	P35197	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YBR138C	P38277	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SDH8	P38345	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YDR089W	P38966	869 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	LYS14	P40971	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	COS12	P53053	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MAK10	Q02197	733 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DON1	Q05610	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TFC6	Q06339	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CRN1	Q06440	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RRT8	Q08219	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	OSW1	Q08692	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	JIP3	O13555	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	AAC1	P04710	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BET2	P20133	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CLB1	P24868	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	OCA4	P25366	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PRD1	P25375	712 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CDC5	P32562	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SRB2	P34162	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MRPL36	P36531	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YSW1	P38280	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MSG5	P38590	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PUG1	P40100	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PSF2	P40359	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SPO22	P40511	975 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YIR014W	P40570	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	FET5	P43561	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BSC5	P53755	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RTC4	P53850	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	VPS75	P53853	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TRS31	Q03337	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GTB1	Q04924	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TRM8	Q12009	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	AHC1	Q12433	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PHO91	P27514	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PEX2	P32800	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	UBP11	P36026	717 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	STB6	P36085	766 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PXL1	P36166	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MTW1	P39731	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SSU1	P41930	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CUL3	P53202	744 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YNL092W	P53934	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	FMP30	Q02883	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ECM18	Q04623	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RRN11	Q04712	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SNO4	Q04902	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CRD1	Q07560	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CIR2	Q08822	631 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HSP32	Q08992	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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