RNA–Protein interactions for RNA: YDR532C

KRE28, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeast

Gene KRE28, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE28	YDR532C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TIM8	P57744	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CDD1	Q06549	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	MED1	Q12321	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SIR1	P21691	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	GSY2	P27472	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	PXL1	P36166	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YBR056W	P38081	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CHS6	P40955	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YFL015C	P43578	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	NPA3	P47122	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YML053C	Q04978	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	BSP1	Q06604	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	FAB1	P34756	2278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	GAC1	P28006	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SWI3	P32591	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CDS1	P38221	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RET2	P43621	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	POL31	P46957	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	ZAP1	P47043	880 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YJR054W	P47114	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TAF4	P50105	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YNR061C	P53747	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SLG1	P54867	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	MUB1	Q03162	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	HER2	Q03557	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	DON1	Q05610	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	GPM2	Q12008	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TGS1	Q12052	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	CRC1	Q12289	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	HOP1	P20050	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TKL2	P33315	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	LOT5	P34234	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	AGP2	P38090	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	TDA3	P38758	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	COS5	P47187	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	SLX4	Q12098	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE28	YDR532C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	RRT12	P25381	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	RAD16	P31244	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	FRE1	P32791	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	KDX1	P36005	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	MGS1	P40151	587 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	GUF1	P46943	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	SAP4	P53036	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	TFB2	Q02939	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	TPK1	P06244	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	GPI10	P30777	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	SIF2	P38262	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	DUN1	P39009	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	RSM25	P40496	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	PRM2	P40534	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	LCB2	P40970	561 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	TOF2	Q02208	771 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	TCO89	Q08921	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	DDC1	Q08949	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	NBP2	Q12163	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	MPD2	Q99316	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	CHS1	P08004	1131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	PPH22	P23595	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	PSO2	P30620	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	AVT2	P39981	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE28	YDR532C	TDA10	P42938	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms