RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P VAC14Q06708 880 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GUP2Q08929 609 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ACM1Q08981 209 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HOS1Q12214 470 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FRE7Q12333 620 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEM1O94742 89 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P QCR6P00127 147 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AI4P03878 556 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RIP1P08067 215 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P INO1P11986 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CBF1P17106 351 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CKI1P20485 582 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC15P22224 910 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO3P24031 467 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TSR4P25040 408 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VAC17P25591 423 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MSH1P25846 959 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P LYP1P32487 611 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STB6P36085 766 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP21P38175 177 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P LDB7P38210 180 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UBS1P38290 277 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VHC1P38329 1120 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P POP4P38336 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RCK2P38623 610 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DBP8P38719 431 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HSE1P38753 452 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SSN3P39073 555 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FAU1P40099 211 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IME4P41833 600 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPG5P42933 373 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC17P47076 161 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM21P48565 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM9P49957 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM8P53179 542 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P BNI4P53858 892 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MET14Q02196 202 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ROT1Q03691 256 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TRS23Q03784 219 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P URH1Q04179 340 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC73Q06697 393 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SLD7Q08457 257 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR056CQ12025 205 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UPC2Q12151 913 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P BMT6Q12291 365 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR061WQ12298 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PNS1Q12412 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AVL9Q12500 764 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC39Q12745 709 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FRT1Q99332 602 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STE2D6VTK4 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO5P00635 467 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC21P06785 304 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CMP2P14747 604 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YSR3P23501 404 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR006CP25350 157 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC20P26309 610 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GDA1P32621 518 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SKN1P33336 771 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM20P35180 183 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P EHT1P38295 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR033WP38690 423 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P EFM1P38732 585 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PLB1P39105 664 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LRO1P40345 661 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P AZF1P41696 914 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PFA3P42836 336 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL107CP42947 387 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
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