RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M VAC14Q06708 880 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GUP2Q08929 609 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ACM1Q08981 209 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HOS1Q12214 470 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FRE7Q12333 620 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SEM1O94742 89 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M QCR6P00127 147 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M AI4P03878 556 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RIP1P08067 215 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M INO1P11986 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CBF1P17106 351 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CKI1P20485 582 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC15P22224 910 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO3P24031 467 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TSR4P25040 408 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VAC17P25591 423 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MSH1P25846 959 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M LYP1P32487 611 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M STB6P36085 766 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP21P38175 177 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M LDB7P38210 180 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UBS1P38290 277 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VHC1P38329 1120 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M POP4P38336 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RCK2P38623 610 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP8P38719 431 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HSE1P38753 452 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SSN3P39073 555 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FAU1P40099 211 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M IME4P41833 600 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SPG5P42933 373 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RPC17P47076 161 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM21P48565 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM9P49957 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM8P53179 542 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BNI4P53858 892 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MET14Q02196 202 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ROT1Q03691 256 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS23Q03784 219 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M URH1Q04179 340 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC73Q06697 393 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SLD7Q08457 257 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR056CQ12025 205 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UPC2Q12151 913 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BMT6Q12291 365 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR061WQ12298 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PNS1Q12412 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M AVL9Q12500 764 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC39Q12745 709 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FRT1Q99332 602 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M STE2D6VTK4 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO5P00635 467 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC21P06785 304 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CMP2P14747 604 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YSR3P23501 404 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR006CP25350 157 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC20P26309 610 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GDA1P32621 518 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SKN1P33336 771 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TOM20P35180 183 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M EHT1P38295 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR033WP38690 423 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M EFM1P38732 585 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PLB1P39105 664 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LRO1P40345 661 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M AZF1P41696 914 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PFA3P42836 336 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL107CP42947 387 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
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