RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K VAC14Q06708 880 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GUP2Q08929 609 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ACM1Q08981 209 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HOS1Q12214 470 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K FRE7Q12333 620 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEM1O94742 89 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K QCR6P00127 147 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K AI4P03878 556 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RIP1P08067 215 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K INO1P11986 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CBF1P17106 351 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CKI1P20485 582 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC15P22224 910 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO3P24031 467 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TSR4P25040 408 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K VAC17P25591 423 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K MSH1P25846 959 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K LYP1P32487 611 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K STB6P36085 766 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K MRP21P38175 177 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K LDB7P38210 180 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K UBS1P38290 277 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K VHC1P38329 1120 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K POP4P38336 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RCK2P38623 610 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K DBP8P38719 431 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HSE1P38753 452 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SSN3P39073 555 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K FAU1P40099 211 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K IME4P41833 600 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SPG5P42933 373 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC17P47076 161 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM21P48565 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TRM9P49957 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM8P53179 542 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K BNI4P53858 892 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K MET14Q02196 202 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ROT1Q03691 256 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TRS23Q03784 219 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K URH1Q04179 340 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC73Q06697 393 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SLD7Q08457 257 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR056CQ12025 205 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K UPC2Q12151 913 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K BMT6Q12291 365 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR061WQ12298 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PNS1Q12412 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K AVL9Q12500 764 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC39Q12745 709 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K FRT1Q99332 602 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K STE2D6VTK4 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO5P00635 467 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC21P06785 304 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CMP2P14747 604 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YSR3P23501 404 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR006CP25350 157 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC20P26309 610 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GDA1P32621 518 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SKN1P33336 771 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TOM20P35180 183 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K EHT1P38295 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR033WP38690 423 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K EFM1P38732 585 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PLB1P39105 664 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LRO1P40345 661 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K AZF1P41696 914 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PFA3P42836 336 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL107CP42947 387 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
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