RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J VAC14Q06708 880 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GUP2Q08929 609 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ACM1Q08981 209 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HOS1Q12214 470 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE7Q12333 620 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SEM1O94742 89 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J QCR6P00127 147 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J AI4P03878 556 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RIP1P08067 215 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J INO1P11986 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CBF1P17106 351 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CKI1P20485 582 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC15P22224 910 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO3P24031 467 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TSR4P25040 408 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VAC17P25591 423 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MSH1P25846 959 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J LYP1P32487 611 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J STB6P36085 766 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP21P38175 177 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J LDB7P38210 180 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UBS1P38290 277 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VHC1P38329 1120 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J POP4P38336 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RCK2P38623 610 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP8P38719 431 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HSE1P38753 452 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SSN3P39073 555 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FAU1P40099 211 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J IME4P41833 600 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SPG5P42933 373 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC17P47076 161 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM21P48565 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM9P49957 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM8P53179 542 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BNI4P53858 892 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MET14Q02196 202 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ROT1Q03691 256 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS23Q03784 219 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J URH1Q04179 340 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC73Q06697 393 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SLD7Q08457 257 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR056CQ12025 205 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UPC2Q12151 913 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BMT6Q12291 365 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR061WQ12298 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PNS1Q12412 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J AVL9Q12500 764 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC39Q12745 709 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FRT1Q99332 602 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J STE2D6VTK4 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO5P00635 467 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC21P06785 304 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CMP2P14747 604 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YSR3P23501 404 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR006CP25350 157 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC20P26309 610 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GDA1P32621 518 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SKN1P33336 771 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM20P35180 183 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J EHT1P38295 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR033WP38690 423 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM1P38732 585 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PLB1P39105 664 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LRO1P40345 661 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J AZF1P41696 914 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PFA3P42836 336 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL107CP42947 387 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
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