RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G1

tW(CCA)G1, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G1, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VAC14Q06708 880 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GUP2Q08929 609 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ACM1Q08981 209 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HOS1Q12214 470 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FRE7Q12333 620 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEM1O94742 89 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 QCR6P00127 147 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AI4P03878 556 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RIP1P08067 215 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 INO1P11986 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CBF1P17106 351 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CKI1P20485 582 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEC15P22224 910 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PHO3P24031 467 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TSR4P25040 408 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VAC17P25591 423 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MSH1P25846 959 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 LYP1P32487 611 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 STB6P36085 766 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MRP21P38175 177 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 LDB7P38210 180 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UBS1P38290 277 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VHC1P38329 1120 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 POP4P38336 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RCK2P38623 610 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DBP8P38719 431 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HSE1P38753 452 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SSN3P39073 555 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FAU1P40099 211 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 IME4P41833 600 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SPG5P42933 373 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPC17P47076 161 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RIM21P48565 533 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TRM9P49957 279 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RIM8P53179 542 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BNI4P53858 892 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MET14Q02196 202 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ROT1Q03691 256 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TRS23Q03784 219 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 URH1Q04179 340 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CDC73Q06697 393 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SLD7Q08457 257 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YDR056CQ12025 205 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UPC2Q12151 913 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BMT6Q12291 365 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YDR061WQ12298 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PNS1Q12412 539 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AVL9Q12500 764 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEC39Q12745 709 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FRT1Q99332 602 aa2.59□□□□□ -1.99
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 STE2D6VTK4 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PHO5P00635 467 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CDC21P06785 304 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CMP2P14747 604 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YSR3P23501 404 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YCR006CP25350 157 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CDC20P26309 610 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GDA1P32621 518 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SKN1P33336 771 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TOM20P35180 183 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 EHT1P38295 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YHR033WP38690 423 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 EFM1P38732 585 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PLB1P39105 664 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 LRO1P40345 661 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AZF1P41696 914 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PFA3P42836 336 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YJL107CP42947 387 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.4 ms