RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)O

tK(UUU)O, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)O, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)OtK(UUU)O URA7P28274 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O AIM26P32858 118 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NFU1P32860 256 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O DOM34P33309 386 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YKL100CP34248 587 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O LDB7P38210 180 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O OCA5P38738 679 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O WSC4P38739 605 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SEO1P39709 593 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O HAT2P39984 401 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SSU1P41930 458 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ZIM17P42844 174 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TAH11P47112 604 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NBP35P52920 328 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O VAC7P53950 1165 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NHX1Q04121 633 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RRN11Q04712 507 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O DIC1Q06143 298 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ATG23Q06671 453 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SKM1Q12469 655 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TOR1P35169 2470 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GAL4P04386 881 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GCR1P07261 785 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SWI5P08153 709 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CIN8P27895 1000 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CWP1P28319 239 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YME1P32795 747 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TFC3P34111 1160 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O EMC3P36039 253 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O YHR033WP38690 423 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O DED81P38707 554 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O DMA1P38823 416 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O REV7P38927 245 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YEL073CP39974 107 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TES1P41903 349 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O MTO1P53070 669 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O MPS2P53159 387 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RIM8P53179 542 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GND2P53319 492 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YDR132CQ03900 495 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O URH1Q04179 340 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YDR278CQ05612 105 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RSC2Q06488 889 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O VHS3Q08438 674 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NUR1Q12066 484 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ADH4P10127 382 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CBF1P17106 351 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O STE4P18851 423 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O KAR4P25583 335 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NTH1P32356 751 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O GDA1P32621 518 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O MRPL37P36532 105 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RIM11P38615 370 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O MNN1P39106 762 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CEM1P39525 442 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O ALR2P43553 858 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CIS3P47001 227 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O NRM1P53718 249 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O OSH6Q02201 448 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SPP2Q02521 185 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RCO1Q04779 684 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O CDC123Q05791 360 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O YLR177WQ06251 628 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O RSC3Q06639 885 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O SYT1Q06836 1226 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)OtK(UUU)O BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms