RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)G2

tK(UUU)G2, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)G2, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 URA7P28274 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 AIM26P32858 118 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NFU1P32860 256 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DOM34P33309 386 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YKL100CP34248 587 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 LDB7P38210 180 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 OCA5P38738 679 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 WSC4P38739 605 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SEO1P39709 593 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HAT2P39984 401 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SSU1P41930 458 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ZIM17P42844 174 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TAH11P47112 604 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NBP35P52920 328 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VAC7P53950 1165 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NHX1Q04121 633 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RRN11Q04712 507 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DIC1Q06143 298 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ATG23Q06671 453 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SKM1Q12469 655 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TOR1P35169 2470 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GAL4P04386 881 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GCR1P07261 785 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SWI5P08153 709 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CIN8P27895 1000 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CWP1P28319 239 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YME1P32795 747 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TFC3P34111 1160 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 EMC3P36039 253 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YHR033WP38690 423 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DED81P38707 554 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DMA1P38823 416 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 REV7P38927 245 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YEL073CP39974 107 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TES1P41903 349 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MTO1P53070 669 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MPS2P53159 387 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RIM8P53179 542 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GND2P53319 492 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YDR132CQ03900 495 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 URH1Q04179 340 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YDR278CQ05612 105 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RSC2Q06488 889 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VHS3Q08438 674 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NUR1Q12066 484 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ADH4P10127 382 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CBF1P17106 351 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 STE4P18851 423 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 KAR4P25583 335 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NTH1P32356 751 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GDA1P32621 518 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MRPL37P36532 105 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RIM11P38615 370 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MNN1P39106 762 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CEM1P39525 442 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ALR2P43553 858 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CIS3P47001 227 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NRM1P53718 249 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 OSH6Q02201 448 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SPP2Q02521 185 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RCO1Q04779 684 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CDC123Q05791 360 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YLR177WQ06251 628 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RSC3Q06639 885 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SYT1Q06836 1226 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms