RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YJL070CP40361 888 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PFD1P46988 109 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W BIR1P47134 954 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W FAP1P53971 965 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TLG1Q03322 224 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RCN2Q12044 265 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PHO81P17442 1178 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W AIM26P32858 118 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TOM20P35180 183 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W EGD2P38879 174 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W MPS3P47069 682 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SKY1Q03656 742 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W REH1Q06709 432 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SYT1Q06836 1226 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W VAM6Q07468 1049 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YOL159CQ08300 171 aa10.27□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TRP3P00937 484 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MET17P06106 444 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ERG20P08524 352 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W HMG2P12684 1045 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ART10P18634 518 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W LRE1P25579 583 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FRE2P36033 711 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TFA2P36145 328 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W AGP2P38090 596 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ROT2P38138 954 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YHR218WP38899 603 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FAD1P38913 306 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MNN1P39106 762 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RBG1P39729 369 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CNN1P43618 361 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W INA17Q02888 182 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PEX12Q04370 399 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CDD1Q06549 142 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W BRE4Q07660 1125 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SAM3Q08986 587 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MDY2Q12285 212 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MOT1P32333 1867 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W COX4P04037 155 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MRP13P12686 339 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CBS2P14905 389 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TRX2P22803 104 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RGT1P32862 1170 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SPC34P36131 295 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W VRP1P37370 817 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YEL023CP39992 682 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ATM1P40416 690 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W COA1P40452 197 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FET4P40988 552 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W VMA13P41807 478 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GLG2P47011 380 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YGR053CP53234 283 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GTR2P53290 341 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ESF2P53743 316 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data10.26□□□□□ -0.77not detected
PRP4YPR178W SLG1P54867 378 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MET14Q02196 202 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FMP30Q02883 468 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RSC9Q03124 581 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TRM12Q04235 462 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YMR321CQ04898 105 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W AAD4Q07747 329 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W APC5Q08683 685 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MED2Q12124 431 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YOL159C-AQ3E769 90 aa10.26□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W THP2O13539 261 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W WHI2P12611 486 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PUP3P25451 205 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PAT1P25644 796 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W UBC8P28263 218 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SMY2P32909 740 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PET112P33893 541 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W XDJ1P39102 459 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GUF1P46943 645 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MON1P53129 644 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SLD3P53135 668 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W LSG1P53145 640 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RMI1Q02685 241 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W UGO1Q03327 502 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FLC1Q08967 793 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YPL247CQ12523 523 aa10.25□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TOP3P13099 656 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ABF1P14164 731 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PKC1P24583 1151 aa10.24□□□□□ -0.77
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