RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	NUT1	P53114	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	VPS64	Q03944	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RTR2	Q12378	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	APC1	P53886	1748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CDC9	P04819	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SGF29	P25554	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RFC3	P38629	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GTO1	P48239	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TAF6	P53040	516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TBF1	Q02457	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPC31	P17890	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CTR86	P25355	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ADK2	P26364	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GCS1	P35197	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YKL071W	P36086	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
PXA1	YPL147W	CDS1	P38221	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	FZO1	P38297	855 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	VAB2	P40003	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SLT2	Q00772	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ATG23	Q06671	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NDE2	Q07500	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GUD1	Q07729	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YCL049C	P25577	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRPL7	P36519	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRPL10	P36520	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	POA1	P38218	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	LYS14	P40971	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	FET4	P40988	552 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GAB1	P41733	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CAF16	P43569	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YFR018C	P43599	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RTT101	P47050	842 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RGR1	P19263	1082 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YJU3	P28321	313 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SEC66	P33754	206 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CCC2	P38995	1004 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	XDJ1	P39102	459 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SSO2	P39926	295 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PIC2	P40035	300 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRX1	P40050	688 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YER085C	P40058	173 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ATM1	P40416	690 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NIT3	P49954	291 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SLD3	P53135	668 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HFI1	Q12060	488 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MCM16	Q12262	181 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	BMT6	Q12291	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	URA4	P20051	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	SPE2	P21182	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	RAD14	P28519	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	TOS1	P38288	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	YHI9	P38765	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	DYS1	P38791	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	RTS2	P40962	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	ALR2	P43553	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	ASK10	P48361	1146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	MRK1	P50873	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	SNX41	Q04053	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	MUM3	Q08750	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	SOG2	Q08817	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	YRR1	Q12172	810 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PXA1	YPL147W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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