RNA–Protein interactions for RNA: YMR123W

PKR1, Transcript of V-ATPase assembly factor, yeast

Gene PKR1, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PKR1	YMR123W	YGL260W	P53056	76 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	SGF73	P53165	657 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	YNL234W	P53857	426 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	VCX1	Q99385	411 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	CDC15	P27636	974 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	GAC1	P28006	793 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	RAD24	P32641	659 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	PDR3	P33200	976 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	HXT9	P40885	567 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	RTS2	P40962	232 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	SMK1	P41808	388 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	CUL3	P53202	744 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	YTP1	P53584	459 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	FCP1	Q03254	732 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	EKI1	Q03764	534 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PKR1	YMR123W	EDE1	P34216	1381 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RPB8	P20436	146 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	DBF20	P32328	564 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PTH2	P34222	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	MIA40	P36046	403 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	ESL2	P36168	1195 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	STV1	P37296	890 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PKP1	P40530	394 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YFR020W	P43600	232 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	VPS4	P52917	437 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YNR061C	P53747	219 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RTT103	Q05543	409 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	BAR1	P12630	587 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	ERG8	P24521	451 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	GID7	P25569	745 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PHO90	P39535	881 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YJL070C	P40361	888 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YIR014W	P40570	242 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SAP185	P40856	1058 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SMC3	P47037	1230 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	REG1	Q00816	1014 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SMA1	Q02651	245 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PSK2	Q08217	1101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PSD1	P39006	500 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RGI2	P40188	164 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	FET5	P43561	622 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	NUS1	Q12063	375 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	BSC1	Q12140	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	ATG9	Q12142	997 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YOR019W	Q99248	730 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PMS1	P14242	873 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
PKR1	YMR123W	ARP1	P38696	384 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	UME6	P39001	836 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	UIP3	P39547	235 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RIC1	P40395	1056 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YIL060W	P40519	144 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	IME4	P41833	600 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	BNA1	P47096	177 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	NNF2	P53253	936 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	CRZ1	P53968	678 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RCO1	Q04779	684 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	INP53	Q12271	1107 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YLR302C	O13544	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	TRS65	P32893	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	CNS1	P33313	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YKL050C	P35736	922 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	RIM2	P38127	377 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	TPM2	P40414	161 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	ZDS2	P54786	942 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	NUP100	Q02629	959 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	INA17	Q02888	182 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	VID22	Q05934	901 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	PSR2	Q07949	397 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	APL4	Q12028	832 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	NKP1	Q12493	238 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	DNA2	P38859	1522 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SSM4	P40318	1319 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PKR1	YMR123W	GLN3	P18494	730 aa		2.72	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.2 ms