RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	LEU5	P38702	357 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NNF1	P47149	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NRM1	P53718	249 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CBF1	P17106	351 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	DPB3	P27344	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CWP1	P28319	239 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TOM20	P35180	183 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YSW1	P38280	609 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ZIM17	P42844	174 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ARP4	P80428	489 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.7	□□□□□ -1.5	not detected
PUF3	YLL013C	BLS1	Q06071	122 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GTT2	Q12390	233 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YCR099C	P25657	155 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	UME6	P39001	836 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	MEF2	P39677	819 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	INA22	P40576	216 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ATP12	P22135	325 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SFP1	P32432	683 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RPC37	P36121	282 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PIM1	P36775	1133 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YJL107C	P42947	387 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TY4A-J	P47023	414 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TFB2	Q02939	513 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	IRA1	P18963	3092 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	HFA1	P32874	2273 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ABF1	P14164	731 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TEC1	P18412	486 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TFC3	P34111	1160 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CEM1	P39525	442 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YAL037W	P39728	267 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YNL320W	P42840	284 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	HXT16	P47185	567 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ZRG17	P53735	605 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	HXT15	P54854	567 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YMR027W	Q04371	470 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	VPS34	P22543	875 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GUT2	P32191	649 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GDA1	P32621	518 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SAE2	P46946	345 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YOR012W	Q12351	137 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.67	□□□□□ -1.5	not detected
PUF3	YLL013C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SSN3	P39073	555 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YEL073C	P39974	107 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	MAL13	P53338	473 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	VPS60	Q03390	229 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CDC123	Q05791	360 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RSC3	Q06639	885 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RMD5	Q12508	421 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GAL4	P04386	881 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PEP5	P12868	1029 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YSR3	P23501	404 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	KAR4	P25583	335 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RSC6	P25632	483 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SSU1	P41930	458 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	BNI4	P53858	892 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GRS2	Q06817	618 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SYT1	Q06836	1226 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NUS1	Q12063	375 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CDC8	P00572	216 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GPA2	P10823	449 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ARA1	P38115	344 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YHI9	P38765	294 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	HST2	P53686	357 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ATG23	Q06671	453 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PFA4	Q12006	378 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SKM1	Q12469	655 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RMP1	Q12530	201 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	STT4	P37297	1900 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RSC2	Q06488	889 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YDR262W	Q12331	272 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	RAD1	P06777	1100 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	DAL82	P21705	255 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	AMS1	P22855	1083 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ATP11	P32453	318 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TIP20	P33891	701 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YER158C	P40095	573 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ECM9	Q02202	377 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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