RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	SRB4	P32569	687 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	UBS1	P38290	277 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	IES1	P43579	692 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	YJR039W	P47107	1121 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	MND1	P53102	219 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	CHS1	P08004	1131 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	TUP1	P16649	713 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	ADY2	P25613	283 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	BLI1	P35727	113 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	DSE1	P40077	573 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	VPS25	P47142	202 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	SPC98	P53540	846 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	JJJ1	P53863	590 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	YMR018W	Q04364	514 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	CDD1	Q06549	142 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	CIR2	Q08822	631 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PAM17	YKR065C	RPN13	O13563	156 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TPK1	P06244	397 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	HIP1	P06775	603 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	FRE1	P32791	686 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TDA3	P38758	523 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PHO86	P46956	311 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ADA2	Q02336	434 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YDL073W	Q07454	984 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YLR001C	Q07895	862 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PRP28	P23394	588 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	HXT1	P32465	570 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TKL2	P33315	681 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	BIT2	P38346	545 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YGR111W	P53265	400 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ARO10	Q06408	635 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	GPM2	Q12008	311 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	APL4	Q12028	832 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	USV1	Q12132	391 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	CKI1	P20485	582 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	AEP2	P22136	580 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YKL050C	P35736	922 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	STB5	P38699	743 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	FMP10	P40098	244 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PIG2	P40187	538 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	IMO32	P53219	342 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	MAS1	P10507	462 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	EMP70	P32802	667 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	AGP2	P38090	596 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YEL020C	P39994	560 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TFB2	Q02939	513 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	MUB1	Q03162	620 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ATG16	Q03818	150 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ABF1	P14164	731 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PGS1	P25578	521 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SEC6	P32844	805 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PCH2	P38126	564 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TCD1	P38756	429 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YNL195C	P40168	261 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	EFM4	P40516	257 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SNZ3	P43545	298 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	BTN2	P53286	410 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SNZ2	P53824	298 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YNL034W	P53963	612 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YNL018C	P53976	612 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	ARO80	Q04052	950 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	TAF9	Q05027	157 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	COQ11	Q05892	277 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	VAC14	Q06708	880 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	APM4	Q99186	491 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PUT4	P15380	627 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	DBF4	P32325	704 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	YEL043W	P32618	956 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PEX2	P32800	271 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	FLO10	P36170	1169 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	KAP114	P53067	1004 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	PNG1	Q02890	363 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	SOV1	Q04748	898 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	NBP2	Q12163	236 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PAM17	YKR065C	HMG2	P12684	1045 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PAM17	YKR065C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21

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