RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W PXL1P36166 706 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CTK2P46962 323 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W VPS25P47142 202 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MPS1P54199 764 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SWF1Q04629 336 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SNO4Q04902 237 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PSK2Q08217 1101 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SSP2Q08646 371 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W HSP32Q08992 237 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MET5P47169 1442 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CHO1P08456 276 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RER1P25560 188 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ECM10P39987 644 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YIR016WP40572 265 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MDV1P47025 714 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YNR061CP53747 219 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RCO1Q04779 684 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W POS5Q06892 414 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.28□□□□□ -1.88not detected
RPL17BYJL177W YOL087CQ99247 1116 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YOR1P53049 1477 aa3.28□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W MRP20P32387 263 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W GND1P38720 489 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W IME4P41833 600 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W IST1P53843 298 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W CBK1P53894 756 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W GSH2Q08220 491 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YLR112WQ12130 139 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W NBP2Q12163 236 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W UBX3Q12229 455 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-FP0CX63 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-CP25384 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.27□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W STH1P32597 1359 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YBR085C-AO43137 85 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W RAP1P11938 827 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W STE50P25344 346 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SSH4P32343 579 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W CBF2P32504 956 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W ALY1P36117 915 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W ESL2P36168 1195 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YFR020WP43600 232 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W ASI1P54074 624 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YPL068CQ02749 293 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W MUB1Q03162 620 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W CAC2Q04199 468 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W PLP2Q12017 286 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SPP41P38904 1435 aa3.26□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W MYO4P32492 1471 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W HSP82P02829 709 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W FUM1P08417 488 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W FMP10P40098 244 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SLZ1P40167 298 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YJR061WP40355 935 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W IRC8P47046 822 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W PIL1P53252 339 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W BOP3P53958 396 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YMR018WQ04364 514 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W OPY2Q06810 360 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W CIR2Q08822 631 aa3.25□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W ATO2P32907 282 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W VRG4P40107 337 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W DPH1P40487 425 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W NNF2P53253 936 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W YTP1P53584 459 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TLG1Q03322 224 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W IZH1Q03419 316 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SKG3Q06315 1026 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W SNA4Q07549 140 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY1B-BRQ12193 1756 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY2B-BQ12491 1770 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W TY1B-ORQ92393 1755 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W LTE1P07866 1435 aa3.24□□□□□ -1.89
RPL17BYJL177W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.6 ms