RNA–Protein interactions for RNA: YJL145W

SFH5, Transcript of Non-classical phosphatidylinositol transfer protein (PITP), yeast

Gene SFH5, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFH5	YJL145W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SPO22	P40511	975 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	CTK2	P46962	323 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	PFA5	Q03289	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	TAF11	Q04226	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	TPO3	Q06451	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MET17	P06106	444 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SPE2	P21182	396 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	HOT13	P36078	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	DOT5	P40553	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ORC5	P50874	479 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ATP23	P53722	227 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	INP53	Q12271	1107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SCM3	Q12334	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	RAP1	P11938	827 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	CKA1	P15790	372 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YCR006C	P25350	157 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ADH7	P25377	361 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MNN2	P38069	597 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ERV46	P39727	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	RGI2	P40188	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	PKP1	P40530	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MAF1	P41910	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	IRC8	P47046	822 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YGR066C	P53242	292 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	BSP1	Q06604	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YEH1	Q07804	573 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SPE4	Q12455	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ORC2	P32833	620 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	UIP3	P39547	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	CIN1	P40987	1014 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	VID30	P53076	958 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ORM2	Q06144	216 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	IRC3	Q06683	689 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	BUD7	Q08754	746 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YPT6	Q99260	215 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	BNR1	P40450	1375 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SGS1	P35187	1447 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ERG11	P10614	530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MAK32	P23060	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YKL050C	P35736	922 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	APL4	Q12028	832 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ERP4	Q12450	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	UBP11	P36026	717 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	PTR3	P43606	678 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	SMC3	P47037	1230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MAK10	Q02197	733 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	PDR8	Q06149	701 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	MCH4	Q08268	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	ATG9	Q12142	997 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFH5	YJL145W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
SFH5	YJL145W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	APN1	P22936	367 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	ROX1	P25042	368 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	SEF1	P34228	1148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	BYE1	P36106	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	ELO1	P39540	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	CDC1	P40986	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	IRC7	P43623	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	YGR127W	P53275	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	VPS38	Q05919	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	OSW1	Q08692	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	RIM20	Q12033	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	RTN2	Q12443	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	GAL80	P04387	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFH5	YJL145W	GPA1	P08539	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.4 ms